『生命エネルギーの付与』どんな人間にも、かけがえの無い者が存在する。人間であろうと、ポケモンであろうと、人はその相手に依存するものだ。生きていれば、ただ共にいるだけで満足出来るだろう。失われれば、依存度が高ければ高い程失ったものを取り戻そうとする。薄明りだけが周囲を照らす巨大な実験室の一角に、培養液に満たされたガラスの柱が作られていた。その培養液の中に浮かぶ裸の少女に向かって、初老の男が話しかける。「お前の死体から遺伝子情報を解析し、新しいお前を作り上げた。この段階に至るまで長い時間がかかった。触れて抱き締めたいとばかりに男は柱に抱き付き、嗚咽を漏らす。「私は狂っているのかもしれない。いや、狂っていたとしても構わない。私はお前をこの世に蘇らせたいんだ。優れた科学技術によって、人間のクローンを作る事に成功した男。それは完全な成功では無かった。数年で溶けて消えてしまう儚い命。泡となって消えてしまった人魚姫の様に。男はその見えている『終わり』を防ぐ為躍起になっていた。「アイ、ミュウには『永遠の命』が備わっている。人間より遥かに長生きするポケモンでも、せいぜい生きるのは百数十年。幻のポケモンと言われる『ミュウ』には不老不死の力が備わっているんだ。その力の謎を解明する事が出来れば、お前にその力を与えてやれる。培養液の中でしか生きられない、あまりにもかよわい生命体。男にとって愛娘を蘇らせ、さらに二度と失わない様にすると言う野望は一生をかけてでも成し遂げたいものだった。ミュウの睫毛の化石が見つかった事で、その野望が実現しそうな所まで来ている。男は少女に呼びかけていると言うより、自分に言い聞かせている様だった。私とずっと一緒にいてくれればそれで良い。『しょうがないなぁ......パパは』アイの幻影を追い求める男に対して、『アイツー』は憐みの感情を向けていた。彼女はアイのクローンであって本物の『アイ』では無い。男はそれを理解していたが、偽物であったとしても本物そっくりの彼女を望んだのだ。アイツーも、アイの代わりとして生まれてきた事が解っていたからこそやるせない気持ちを抱えていた。アイツーが入っている培養液で満たされたタンクの隣に、別のタンクが設置される。そのタンクで『ミュウツー』の育成が始まった。「ミュウツーが私の手駒になれば、カントー......いや、世界が私に跪くのと同義だ。フジ、ミュウツーの睫毛の化石は替えが効かん。ミュウツーの成長スピードは凄まじいものですが、暫しお待ちを。幼体の状態では、ミュウに匹敵するパワーを発揮する事は出来ません」ロケット団の総帥、サカキはミュウツーを使った世界征服を企む。男はそれに加担するフリをしながら、ミュウツーのパワーをアイに分け与える方法を模索していた。永遠に生きる力は、ミュウやミュウツーの身体から発せられる特殊な『波動』に秘密がある。通常のポケモンと違い、傷を負っても即座に再生する驚異的な生命力をアイに与えればアイは人間を超越した存在となる。それを調べる時間が、男にもアイツーにもそう長くは残されていなかった。『ココは人工的にポケモンを生み出す為の研究所。幼体として目覚めたミュウツーに、アイツーが語り掛ける。ミュウツーには相手の心の声を読み取るテレパシー能力が既に備わっていた。