(次数の最大値(図6では5としています。いう2通りの解釈が可能です。記法においては水素原子を明記せず、特徴量の計算でも水素は用いないため1)では単結合の時と区別がつかなくなってしまいます(二酸化炭素に対してメタンジオールは同じ予測値が得られます)。2)の場合も二酸化炭素とオルト炭酸の区別がつかないように思われます。層を二層以上にすると異なる予測値が得られます。例として二層の時を考えます。最終層ではどちらの炭素原子にも酸素原子4つの特徴量ベクトルが足されますが、一層手前で1つの酸素原子に足される特徴量ベクトルがメタンジオールでは炭素原子1つ分、二酸化炭素では炭素原子2つ分となるため、最終層で炭素に足される炭素原子の特徴量ベクトルの数は異なります。この違いについて、簡単のために二酸化炭素の片方の酸素のみに対しての違いを模式化した図を図7に示します。隣接する原子数Nの解釈の違いと区別の有無このように1)で区別できない多重辺の有無も十分な層の深さを確保した下で2)を使用することにより区別が可能となります。)では1)の解釈を採用しています。上に述べたように1)では多重辺の識別ができなくなってしまいます。(以下、改良版と呼びます。実装し、2つのモデルの精度を比較することでドメイン知識に基づいてアルゴリズムの解釈を変えた際の予測精度への影響を実験、考察しました。版と改良版の変更点はアルゴリズムの解釈です。具体的な実装の内容及び違いとしては以下の様になります。実装はグラフの行列表現を入力として受け取るため、この行列表現部分を変更しました。