生命プロセスに介在する小分子化合物の辞典です。ゲノムに直接コード化されている分子(例:核酸、タンパク、ペプチド)はこのデータベースの対象外です。登録されているデータは、多数の情報源のデータを組み合わせ、冗長性を除いています。COMPOUND、PDBeChem(EBI)、ChEMBL(EBI)です。ChEBIオントロジー(化合物オントロジー)による分類情報と階層表示が特徴です。3つ星:ChEBIチームが手作業で注釈付けを行ったもの。2つ星:ChEMBLチームまたはデータ提供者が手作業で注釈付けを行ったもの。1つ星:情報源から自動的に取得した仮エントリーで、手作業での注釈付けが行われていないもの。