サーバのセキュリティ確保のため、ASCIIモード転送による改行コードの自動変換機能は無効にしています。改行コードをUNIX用(LF)に変更してからアップロードしてください。場合、BOM無し(UTF-8N)になっているか。BOM有りだとプログラムが動作しません。プレーンテキスト形式で保存してください。(RTF:リッチテキスト形式では動作しません)文字化けする場合、METAタグなどによる文字コードの設定をし忘れていないか。