保存中は、種子を乾燥させないこと。水が濁らないように、ときどき水を入れかえてあげましょう。ミズアオイの種子は、乾くと発芽率がおちるので、水の中に沈めて保存します。種子はペットボトルなど、小さめの容器に入れておくほうが便利です。バケツから容器に入れかえましょう。入れ換えるときは、漏斗を使うと種子を落とさずに簡単にできます。直射日光の当たらない場所に置きましょう。冷蔵庫に保存できると一番良いです。冬季保存中には、ときどき水の入れかえをおこなうようにします。水がにごってきたら早めに入れかえてあげましょう。