byteインフルエンザゲノム解析を自動化FluGASはインフルエンザウイルスの型判定とゲノム配列の決定を行うソフトウェアです。高速シーケンサ(NGS)を用いたウイルスゲノムのシーケンスデータ解析に特化しており、搭載されたワークフローは検体に含まれるインフルエンザウイルスに最適な参照配列の決定と複数回のアライメントを通じてHA・NA亜型の判定と全8分節のゲノム配列の構築を自動的に実施します。B型インフルエンザの場合は亜型に替えてYamagata/Victoria系統の判定を行います。解析はソフトウェアの画面へFastqファイルを指定するかドラッグアンドドロップするだけで実行され、亜型判定の結果を記載したExcelファイルと8分節のゲノム配列がFasta形式で出力されます。Nanoporeから出力されるFast5ファイル*の両方に対応しています。readの場合はMinimapが使用されます。readも解析に使用することができます。windows版をご用意いただく必要があります。10上で動作するソフトウェアです。解析に必要な操作やパラメータの設定は簡易なGUI上の操作で完了します。解析結果には検体ごとの亜型の判定結果と各分節のゲノム配列が表示されます。検体中に複数のウイルス株が混在している場合、存在量の多い上位3種類までの株について亜型の判定結果とゲノム配列が出力されます。最近の改良点ゲノム配列決定精度の改善アライメント結果からのコンセンサス配列作成アルゴリズムを改良したことにより、特に挿入・欠失変異を保持するウイルス株の場合に分節ごとのゲノム配列作成精度が向上しました。B型インフルエンザの系統判定機能を追加B型インフルエンザのHA分節ゲノム配列を元に、Yamagata/Victoria系統を判定できるようになりました。参照配列の更新機能を向上1回目のアライメントで使用されるインフルエンザウイルス参照配列もGUI上で更新できるようになりました。任意の配列をユーザーが参照配列に加えることが可能になりました。sequencerが出力したシーケンスデータも解析できるようになりました。readのアライメントに使用するBowtier2の実行パラメータを変更できるようになり、アライメント時に要求する相同性を変更できるようになりました。解析速度の向上ワークフロー内で使用されるプログラムの一部に並列処理を組み込んだことで解析に必要な時間が短縮されました。成果を元に株式会社ワールドフュージョンが開発・販売しています。subtyping.。