有馬稲子と不倫関係を持ち、後に有馬が堕胎したことを彼女自身が書いている[9][10]。キネマ旬報社の叢書「世界の映画作家」では、ついに最後まで『採り上げられなかった』。東宝争議では離脱派の助監督の先頭にたったことは長く尾を引き、その後、右派的な言動や作品はほとんど無かったにもかかわらず、左翼系の評論家(特に日本共産党系)には後年まで目の仇にされていた。黒沢明は、市川崑について、金をもうけることばかり考えていると指摘した(ただし、市川作品の企画やマーケティングはほとんど会社側が行っており、市川自身は依頼された演出をこなすだけで興行的成否には、その名前のブランド力以外に別段関与していない)。名声を得るようになってからも、というよりむしろ逆に初期作品のような風刺映画は影をひそめ、社会的テーマを前面に掲げるようなことを排除していた。性描写にもほとんど踏み込まない作家であった。らは全く認めようとしなかった。荻昌弘も、市川作品の中ではほとんど無視に近い扱いを受けている『病院坂の首縊りの家』『竹取物語』を映像限定で絶賛する一文を書くなど好意的であった。ら、その志向を支持する方面からの評価も高い。皮肉屋の一面もあった。そのため、まったくそりの合わなかった一人に『股旅』の主演者・萩原健一がいる。『日本映画[監督・俳優]論』では、萩原が顔をハチに刺された際に「すいません」と謝ると、市川昆は「おまえ、長谷川一夫じゃねえんだろ」と冷酷に言い放ったという[11]。萩原は、遠まわしな批判から始めて話しているうちに、不愉快な経験を思いだし、「大嫌い、市川崑」と述べている。60年の監督生活を長期間特定の会社に専属することなく過ごし、なおかつ低落し続ける日本映画界でほとんどブランクなく撮り続けたが、これだけ各社を飛び回りながら、大手映画会社では松竹とだけ縁がなかった[12](東映では東横映画時代に1本撮っている)。1980年代に半村良の『妖星伝』映画化が同社製作で発表され、そのほか池波正太郎作品の映画化やシネマジャパネスクでも名前があがったが、いずれも実現しなかった。五社英雄による自作の映画化の出来を嫌った池波は後継に市川を希望したが、結局条件があわず、降旗康男が立っている。ちなみに、池波は映画ファンとしては洋画に偏向しており、この際に沢島忠の名を知らなかったために退けた。市川は1970年代から1980年代にかけて、6本の東宝映画をプロデューサー兼任で監督している。日本映画で、監督が自ら出資することなく大手の映画に2本以上連続して兼任プロデューサーで迎えられ続けた例は他にない。市川は元々東宝育ちながらかなり長期間同社と絶縁に近い状態にあったこともあり、プロデューサーシステムの厳しさで有名な東宝でこの待遇を得たのは、スタジオ制度の変質も影響しているとは思われるが、異例の厚遇である。