12メートル沖の海底を3メートル掘下げ、長さ25メートル、幅12メートル、海底からの高さ15メートルの人工島をつくり、これに船舶を接岸させるという新方式のものになった。社船『夕顔丸』が廃船。夕顔丸は日本で最初に出来た鉄船であった。三菱長崎造船所で明治20年5月26日に竣工された鉄船で、当時の建造費33,550円であった。永きにわたり、いとしき便利を乗せる船として大いに活躍し、高島端島島民の足として親しまれたが寄る年波には勝てず、37年3月31日をもって社船としての大役を果たし、75年の航跡を残し廃船となった。ブランコ、すべり台、船着場等を設置、完成した。端島で緑化運動の兆しが見え始める。土を運び、屋上空地を利用して花壇、畑、温室等を造った。町立端島公民館が落成。総事業費1,759万円(このうち国庫100万円)で、鉄筋コンクリート造3階建、面積478.5m2の公民館を建設した。消火作業中に、ガス爆発が起り、多くの死傷者が出た。1,056人から524人へと大幅な減員を行なった。その他を含め、約2,000人が端島を去った。三ツ瀬新坑4枚層に着炭。昨年のガス爆発事故による消化の為、端島砿のメイン採炭区域であった深部をやむなく水没させ、採炭不可能状態が約1年続き苦しい時期を端島は迎えていた。かわる新採炭区域を三ツ瀬区域に切り換え、39年9月から三ツ瀬開発工事が開始。39年9月~40年1月末迄、炭層(石炭がある層)にたどりつくための採掘が毎日続けられたが、当然、黒い石炭は1トンも上がってこなくて、出るのはボタ、岩石ばかりであった。毎日坑内から上がってくるボタで、端島西海岸の護岸沿いに人工ボタ浜が出来あがる始末であった。炭砿に仂く者にとって出炭がない程みじめで寂しいものはない。この様な暗い時期が約1年続いたが、全従業員は新生端島砿のために頑張り抜いた。その努力の結果、40年2月10日、三ツ瀬4枚層に着炭し、島は長かった冬眠から覚める如く活気づいた。飛躍するという大前提に沿って8月12日、労使双方の交渉がまとまり、9月13日より本格的操業に入った。新生端島の発足を記念して精出しに祝賀式典が催された。端島砿開坑以来の月産35,000トン出炭を記録。40年下期、新三ツ瀬区域移行后、今までの採炭方式を変え、鉄柱、カッペ及びドラムカッター等による新方式を取り入れた。始めは新機械等の不慣れな点や、炭層傾斜の変化等もあったが、坑内員各人のたゆまぬ努力という強力な支援によって、端島砿開坑以来の月産35,000トンという快記録が、40年12月樹立された。石炭汽缶を重油汽缶に切り替えた。3,264万円で鉄筋コンクリート造4階建12戸収容の教職員住宅を建設した。呼応するため、三菱鉱業は最善の方策として、石炭部門を完全に独立させる事に決定。2,718人、職員数337人、出炭高1,161,000トン。端島砿砿員数674人、職員数87人、出炭高319,300トン。鯰田砿砿員数56人、職員数26人、出炭高18,089トン。総事業費46,958,000(このうち国庫11,326,000円、起債1,110万円)で、鉄骨及鉄筋コンクリート造2階建、面積385m2の体育館を建設した。1階は格技室と給食室、2階は体育館となっている。木造組住宅(学校横)が全焼。死者2名を出す火災となった。人口14,518人、世帯数4,021世帯。45年は三菱が創業されて丁度百年にあたる。それを記念した大運動会が催された。