9今日もブログ読者を鋭意醸し中。微生物扱っている人にはかなり楽しいと思う。ECO詐欺このブログでも過去に何種類もの詐欺を取り上げましたが、このシリーズはマジでお勧め。あふれる健康食品や代替医療薬によって引き起こされた健康被害の事例をまとめたデータベースです。私がメインに使っている生物学の教科書です。高いですが値段分以上の価値あり。日本語訳が出版された進化生物学の教科書です。生命誕生から多細胞生物の発展まで、現在の進化生物学の俯瞰図を把握できます。種の起源ダーウィンの「種の起源」に、図版や現代進化生物学の観点からの注釈を加え、読みやすくまとめ直したものです。進化論がどのような経緯で提唱されるに至ったかを示す不朽の名著です。盲目の時計職人ドーキンスの秀作。進化論を語るならこれくらいは読んでおきましょう。ラボ・ダイナミクス科学者のためのセルフマネージメント本。今ドクターに進学しようとしている人で、こういうことを考えない人は稀だと思いますが。一月ほど前のことになりますが、進化生物学方面のエポックメイキングな論文が発表されました。うまくまとめ切れなかったんですが、ようやく満足のいく記事に起こせたので紹介します。PNASこの論文は大腸菌を4万4千世代にわたってひたすら培養し続け、どのような進化の過程をたどるのか観察するという、20年もの歳月をかけたものすごい実験の報告です。この進化の過程の中で、大腸菌はクエン酸を資化するCit+という本来存在しない機能を獲得しており、さらに重要なことには、500世代ごとに採取されていたフリーズストックを用いることで、この進化の過程は再現することも可能でした。これは複数の遺伝子変異の積み重ねによって生物が新たな機能を獲得する進化の過程を実験室レベルで直接観察し、再現することに成功した初めてのケースとなります。細菌は種間の遺伝子の水平移動が存在するため種の定義があいまいなのですが、表現型で分類をしていた昔の定義に従うならば、この大腸菌は大腸菌ではない新たな種になったといってもいいでしょう。◆大腸菌の進化この実験で、著者のLenski博士は、大腸菌を12の培養器に分けて、それぞれ独立して4万4千世代にわたって培養を行い、各群の変化を調べています。各群の共通した進化傾向として、増殖速度の上昇と細胞の大型化、ピーク密度の低下が見られたのですが、3万3000世代付近で1群だけに他の群と違った形質が出現しました。通常はクエン酸を養分として利用できないはずの大腸菌が、突如としてクエン酸を食べるようになったのです。Lenski博士は即座にこれがコンタミでなく大腸菌の変異であることを確認し、さらに過去のフリーズストックを起こして再現実験を行い、この群の2万世代以降のストックからならクエン酸利用能(Cit+)の進化のリプレイが可能であることを確認しました。この群の2万世代付近で、Cit+遺伝子の獲得につながる重要な変異が起こったのです。2万世代以前のストックや、他の群のサンプルからの有限回の試行では、Cit+の獲得は再現できませんでした。Lenski博士は2万世代付近で起きたこの潜在的なクエン酸利用能の獲得のことを”potentiating”と表現しています。ストックを詳細に分析することで、クエン酸利用能の獲得が、まず弱いクエン酸の利用能獲得後に、別の変異によって強いクエン酸利用能へと進化したことが確認されました。この大腸菌群のクエン酸利用能の獲得は最低でも、1.2万世代付近の潜在的なクエン酸利用能の獲得2.3万1500世代付近の弱いクエン酸利用能の獲得3.3万3000世代付近の強いクエン酸利用能の獲得という三段階の進化によって支えられていることになります。これは表現型のみを見た場合の話ですから、遺伝子の変異を解析したら進化のステップ数がさらに増えるかもしれません。Zimmerのブログがかなり良い解説を書いています。英語を読める人は是非ご一読を。population.私もずっと微生物扱ってきた人間なので、こういうの読むともうワクワクしてたまらないのですよ。目の前ではっきりと分かる形質を獲得しながら進化していく大腸菌。大腸菌の増殖速度が大体1世代20分程度、1週間で500世代程度なので、3万1500世代あたりのストックを分けてもらえれば一月程度で、2万世代あたりのところからでも、1年もあれば進化の再現が可能ですかね。論文の著者のBlount博士らはそれを行ったわけですが、再現実験楽しかったろうなあ。あるのですが、おそらくこの2万世代付近で起こった変異は重複、転座、逆位あたりの、一定領域の変異が一度に起こるタイプのものだと思われます。いったタイプの変異は点変異に比べ著しく再現率が下がります。Cit+を獲得した群は、2万世代付近でこうした変異を得てCit+獲得のための下地を得たのでしょう。その後の変異はストックから容易に再現されたことから見ても、単なる点変異の積み重ねによって獲得されたものだと思われます。具体的にどのような遺伝変異がCit+の獲得に結びついたかは、今後のゲノムの確認によって明らかにされるはずです。Gaps"(科学の隙間)から追い出されることになった創造論者達の話。この論文は進化生物学史に新たな一歩を刻む重要なものなのですが、それは裏を返すと創造論者やID論者達に新たな鉄槌を下すものでもあるわけです。日本の連中は不勉強なのか反論できないのか反応すらしていませんが、欧米の創造論者は苦し紛れにヘンテコリンな反応をして海外のウォッチャーを笑わせています。その辺の話は忘却からの帰還のKumicitさんが詳しく分析されているので記事リンクを紹介しておきます。個人的にはよく調べもせずにこの実験に反応し、自爆して涙目なBeheがツボでした。|この記事へのコメント黒影さん、こんばんわ。興味深いエントリーありがとうございます。元論文は読めない立場なのですが、少し質問を。12の培養器に分けたとありますが、これは遺伝的に異なる12の実験室系統を使ったという意味でしょうか?それならば、1群にしか今回のような現象が起こらなかったのは気になる所ですね。どの領域に変異が起こったのかも今後のゲノム解析が待たれます。後、クエン酸ということで代謝系かな?と思ったので、少し調べた時に以下のサイトを発見しました。01:39神が文字通り全知全能で、全てが神の御業の中にあるのならば、ひとつの培養器に起きた事も偶然ではありえず、これもまた神のなせることに過ぎないという事になりそうですが。創造論者の本拠地アメリカは変に(聖書の記述に忠実な)原理主義だったりするので、こういうところにひっかかったりするのかな?それとも「インテリジェントデザイン」なんてお題目が出る時点で、神の全能性を限定してるのか?kahjinさん、遺伝的に異なる12の実験室系統で出発したなら、1群にしか起こらなかったことはむしろ当然になってしまいそうですね。そこを気にされてるのでしょうか。進化の類似性の記述もありますし、「忘却からの帰還」に孫引きされてる原論文の結論からみても、同一系統&ほぼ同一条件化での培養だったんではないんでしょうか。私も元論文は読めない立場ですので、テキトーですが。>Cruさん>それとも「インテリジェントデザイン」なんてお題目が出る時点で、神の全能性を限定してるのか?全能の神を言ってしまうと反証可能性をクリアできず科学になれないので、それで持ち出されたのがインテリジェントデザインですからね。gaps”に隠れることしか出来ず毎回踏み潰されるんですけれど。02:02>Cruさん、黒影さんどうもです。複数系統でやっていた方が、より強い証拠になりますから。ラクトースの例もあるようですし。それでも、最初から狙っていたとはとても想像出来ない(笑)このような結果がでた時の興奮はすさまじいですね。「ダーウィンの説はあくまで仮説に過ぎない」説への反論根拠になるのでしょうか。わたしには今西進化論でいう「変わるべくして変わる」という理論を立証しているように思われます。大腸菌がクエン酸を資化するCit+という本来存在しない機能を獲得したのは、まさに変わるべくして変わったに過ぎないのではありませんか。この実験結果がどうダーウイン進化論を論証しているのかお教えください。07:30黒影くんは英語力がかなり貧弱ですこの論文もきちんと読めていません自分で確認できないものですから...再現実験楽しかったろうなあ...などと哀れな事を言っています^^......今後のゲノムの確認によって明らかにされるはずです。続報が楽しみですね......とありますが、もう4年以上経過しておりますが、続報は一切ありません。04:53......今後のゲノムの確認によって明らかにされるはずです。黒影くん!再現実験、自分でやてみろ己の恥を知りなさい、恥を!教えておいてやるが、大腸菌は何十年経ってもただの大腸菌。08:01......無論論文の著者のBlount博士らはそれを行ったわけですが、再現実験楽しかったろうなあ......楽しい筈がありません。再現実験ではなにも起こりませんでした。残念〜〜進化が現在進行形で行われているって^^いやしくも現役の分子生物学者にこんなお馬鹿な主張をされては、ため息を付くしかないよね。08:04......今後のゲノムの確認によって明らかにされるはずです。続報が楽しみですね......で、ゲノムはどうなったんだ?進化が現在進行形で行われているって^^いやしくも現役の分子生物学者にこんなお馬鹿な主張をされては、ため息を付くしかないよね。08:07......無論論文の著者のBlount博士らはそれを行ったわけですが、再現実験楽しかったろうなあ............今後のゲノムの確認によって明らかにされるはずです。08:10......今後のゲノムの確認によって明らかにされるはずです。linkの意味が分かってないだろーー「種の起源」を原書で読めなくては話にならんのだ^^進化が現在進行形で行われているって^^いやしくも現役の分子生物学者にこんなお馬鹿な主張をされては、ため息を付くしかないよね。17:38大腸菌は進化などしませんでしたと素直に認めなさい。性格最悪、......無論論文の著者のBlount博士らはそれを行ったわけですが、再現実験楽しかったろうなあ............今後のゲノムの確認によって明らかにされるはずです。05:05>この論文は進化生物学史に新たな一歩を刻む重要なものなのですが、それは裏を返すと創造論者やID論者達に新たな鉄槌を下すものでもあるわけです。恥を知りなさい>日本の連中は不勉強なのか反論できないのか反応すらしていませんが、欧米の創造論者は苦し紛れにヘンテコリンな反応をして海外のウォッチャーを笑わせています。こんな三流記事で大騒ぎしたお前さんを皆笑ってるって^^>個人的にはよく調べもせずにこの実験に反応し、自爆して涙目なBeheがツボでした。08:49>この論文は進化生物学史に新たな一歩を刻む重要なものなのですが、それは裏を返すと創造論者やID論者達に新たな鉄槌を下すものでもあるわけです。黒影がカスである事を明らかにする文言だな^^新たな第一歩だって^^おめでたい人だ^^進化が現在進行形で行われているって^^いやしくも現役の分子生物学者にこんなお馬鹿な主張をされては、ため息を付くしかないよね。19:57>私もずっと微生物扱ってきた人間なので、こういうの読むともうワクワクしてたまらないのですよ。>目の前ではっきりと分かる形質を獲得しながら進化していく大腸菌。16:42>現在の分子生物学の焦点はもっぱら突然変異による進化論を補足する段階へと移っている。創造論などお呼びじゃないのだ。現役の分子生物学者として一言こんな事を言っているのはここの管理人さんだけです。私たちの研究成果から申し上げれば、進化は謎のままです。大腸菌が進化したなどという事実はありません。08:24......無論論文の著者のBlount博士らはそれを行ったわけですが、再現実験楽しかったろうなあ............今後のゲノムの確認によって明らかにされるはずです。19:38......無論論文の著者のBlount博士らはそれを行ったわけですが、再現実験楽しかったろうなあ............今後のゲノムの確認によって明らかにされるはずです。19:51>細菌は種間の遺伝子の水平移動が存在するため種の定義があいまいなのですが、表現型で分類をしていた昔の定義に従うならば、この大腸菌は大腸菌ではない新たな種になったといってもいいでしょう。04:58そもそも、進化論とは実証科学の対象外である事を知っておく必要がある。進化論は科学ではなく、形而上学と言った方が正しい。実証的なデータの積み重ねによって演繹された結論も仮説の域を出ない。進化のような実験不可能な現象は仮説とは全く別もので、形而上学によって帰納されたものでなければならない。その形而上学は従来の科学による結論を包超していなければならないのは当然のことである。その形而上学で最も有力な理論を紹介しよう進化とは黒影くんが念仏のように唱えている突然変異によってもたらされる事は絶対に無い。私に言われせれば、マンがの世界だ真の進化とは従来型の突然変異の概念とは別の、言わば第二の突然変異、特別な条件の下でしか決して起こらないダイナミックな突然変異によってもたらされる。21:09......無論論文の著者のBlount博士らはそれを行ったわけですが、再現実験楽しかったろうなあ......楽しい筈がありません。03:59>この論文は進化生物学史に新たな一歩を刻む重要なものなのですが、それは裏を返すと創造論者やID論者達に新たな鉄槌を下すものでもあるわけです。進化生物学史の新たな一歩だって^^>日本の連中は不勉強なのか反論できないのか反応すらしていませんが、欧米の創造論者は苦し紛れにヘンテコリンな反応をして海外のウォッチャーを笑わせています。こんな三流記事で大騒ぎしたお前さんを皆笑ってるって^^>個人的にはよく調べもせずにこの実験に反応し、自爆して涙目なBeheがツボでした。04:04>この論文は進化生物学史に新たな一歩を刻む重要なものなのですが、それは裏を返すと創造論者やID論者達に新たな鉄槌を下すものでもあるわけです。21:00>この論文は進化生物学史に新たな一歩を刻む重要なものなのですが、それは裏を返すと創造論者やID論者達に新たな鉄槌を下すものでもあるわけです。進化生物学史の新たな一歩だって^^可哀そうに......^^>日本の連中は不勉強なのか反論できないのか反応すらしていませんが、欧米の創造論者は苦し紛れにヘンテコリンな反応をして海外のウォッチャーを笑わせています。自分が笑わている事に気が付かない哀れだ^^>個人的にはよく調べもせずにこの実験に反応し、自爆して涙目なBeheがツボでした。08:55>私もずっと微生物扱ってきた人間なので、こういうの読むともうワクワクしてたまらないのですよ。目の前ではっきりと分かる形質を獲得しながら進化していく大腸菌。大腸菌の増殖速度が大体1世代20分程度、1週間で500世代程度なので、3万1500世代あたりのストックを分けてもらえれば一月程度で、2万世代あたりのところからでも、1年もあれば進化の再現が可能ですかね。論文の著者のBlount博士らはそれを行ったわけですが、再現実験楽しかったろうなあ。12:06>私もずっと微生物扱ってきた人間なので、こういうの読むともうワクワクしてたまらないのですよ。目の前ではっきりと分かる形質を獲得しながら進化していく大腸菌。大腸菌の増殖速度が大体1世代20分程度、1週間で500世代程度なので、3万1500世代あたりのストックを分けてもらえれば一月程度で、2万世代あたりのところからでも、1年もあれば進化の再現が可能ですかね。論文の著者のBlount博士らはそれを行ったわけですが、再現実験楽しかったろうなあ。