variationデータのケースコントロール解析処理についての覚書を続けている。EM最大でなるコピー数アレルを有するCNVを考える。集団内に実在するか否かは考慮せず、コピー数がの種類のアレルが存在するものとする。ディプロタイプを考える。EM先日、EMアルゴリズムによるハプロタイプ頻度推定が、その初期値設定に依存して、異なる解に収束することを例示した。その様子をプロットで示すとこのようになる。エクセルはブルーのセルに2SNP、9ジェノタイプの人数を入れる。最尤法EMアルゴリズムは、その簡単なアルゴリズムにも関わらず、最大尤度を与える推定値への収束が知られている。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。