プラットフォーム(BINDS)の実施機関として「生体分子の電子顕微鏡解析」を支援メニューとし、国内研究者への支援および支援メニュー関連技術の高度化を行っているサイトを指します。E1サイトの実施者は、国内の研究者からの依頼に応じ、該当サンプルの電子顕微鏡実験の実現可能性を判断し、可能な場合には、サンプルの電子顕微鏡実験を行いながら、クライオ電子顕微鏡実験による構造解析を目指したサンプルスクリーニングを行います。このE1サイトにおけるサンプルスクリーニング実験の結果は、E2サイトにおける最先端の電子顕微鏡装置を使ったクライオ電子顕微鏡解析のための予備データとして活用することができます。E1サイトにおける実験は、E2サイトにおけるクライオ電子顕微鏡解析のための第一ステップという役割をもちます。