昨日は高次元分割表の場合列挙をやってみた。列挙ができたら(所要時間の問題はさて置き)、その正確生起確率が計算できて、それを使って、「Fisherの正確検定」もできることになる。今、2x2分割表があり、サンプル総数を、縦軸の比率が、横軸のそれがとする。2x2のセルの観測値をとする。自由度1のカイ自乗分布において、そのとなる確率密度は、で与えられる。このテーブルの正確生起確率はで与えられる。正確検定アレルタイプ数をとする。Diploidではジェノタイプは。アレルをとし、その頻度を、観測本数をすると、ジェノタイプの観測人数がと表せる。今、HWEにおける期待人数は,(ただしを観測人数、)と表される。カイ自乗検定をするとすれば、、として表せる。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。