全ソースコードを得る方法を書きます。ウェブからソースコードをみる一番簡単にソースコードを見る方法はウェブ経由でソースコードレポジトリを表示することです。しながらや電車のなかで、ソースコードが見れるのが良いですね。ひとつのパッケージがひとつのディレクトリになっています。そもそも動いているコードを見ないと意味がありません。稼動状況は以下で見ることができます。各パッケージの動作状況です。使ってソースコードを得る3Gぐらいあります。以下のコマンドですべてのソースコードを得ることができます。ディレクトリにすべてのソースコードがダウンロードされています。こちらもひとつのパッケージがひとつのディレクトリになっています。https://hedgehog.fhcrc.org/bioconductor/trunk/madman/Rpacks/Biobase[/code]です。http://bioconductor.org/developers/source-control/さて、次回からソースコードを読みます。どのパッケージを読みましょうかね?続きます。2013DNAをPCR法で増幅するために必要なサーマルサイクラーを自作してみました。自作と言っても、いわゆる、PCの自作と同じでパーツを組み立てていく感じです。購入から組み立ての様子を簡単に紹介します。ラボには様々なレクリエーションがあります。どこかに遊びに行ったり、スポーツ大会したり、ひたすら合宿形式でプログレスのプレゼンをするミーティングするなどがあります。行う、というイベントを企画してみました。夏休みの自由研究や社会科見学的なノリです。うちのラボでは、PCRを使ったウェットの実験技術の開発をしてきました。サーマルサイクラーのハードウェアの仕組みを体験的に理解している訳ではありません。そこで、サーマルサイクラーを作ってみました。ムーブメントを体験するのも目的の一つです。ハードウェア開発が思っているほどハードルが下っていることを体験できて、かつ、将来、ウェットの開発だけでなく、装置開発などもできたら、ラッキー、ぐらいの気持ちでやってみました。今回作ったのは、組み立て式で、かつ、仕様などや設計図が公開されているOpenPCRというサーマルサイクラーです。ソフトウェアなどの情報がすべて公開されており、部品からも自作することが可能です。今回は、「設計図から部品や回路のパーツを作り、それらを組み立てる直前のもの」を購入しました。