GWAS後(GWASスクリーニング後のこと。GWAS後(GWASスクリーニング後のこと。検定この記事はこちらの記事の続き。今、コピー数アレルがある。ディプロタイプが確定できるとき、ジェノタイプは。ディプロタイプが確定できず、保有コピー数が確定できるとき、ジェノタイプは。variationデータのケースコントロール解析処理についての覚書を続けている。EM最大でなるコピー数アレルを有するCNVを考える。集団内に実在するか否かは考慮せず、コピー数がの種類のアレルが存在するものとする。ディプロタイプを考える。正確検定アレルタイプ数をとする。Diploidではジェノタイプは。アレルをとし、その頻度を、観測本数をすると、ジェノタイプの観測人数がと表せる。今、HWEにおける期待人数は,(ただしを観測人数、)と表される。カイ自乗検定をするとすれば、、として表せる。検定CNV多型についての論文メモと、CNV多型のケースコントロール関連検定についての現状をまとめた(記事はこちら)。おおまかに言って、6、7年前のSNP2x3分割表検定の頃と同じ事情のようだ。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。