壁と屋根野地板との隙間に板を嵌めたこと、雨漏りによる屋根修理など細かい改修はなされていたが、平成25年から27年にかけて屋根葺替えと小屋組修理を主とする大規模な修理が行われた。修理、懸魚の新調、小屋材の交換、壁の塗直し、垂木鼻の交換等が主の内容であった。いずれも建物の文化財的価値に配慮した修理といえる。この修理により未調査であった小屋裏には特別な空間はなく、内部は一階であることが判明した。トラス、挟み束や火打・筋交などの斜材、ボルト・金物等の近代木造技術が使用されていたことも判明し、近代本堂建築としての性格がより明らかになった。