Fstとにつきあるときはf,あるときはFst,あるときはfst,などと表記が入り組んでいた。この記事で述べた言い換えのこともある。inbreedingHWDもLDも、SNPペアのジェノタイプの分布に従属性を発生させる要因である。LDは、1パラメタにて9ジェノタイプ全体に及ぶ依存関係を発生させる。fLEのときの頻度とLDのときの頻度の差をとし、LDのときのハプロタイプ頻度を次のように表すと、9ジェノタイプの乖離はLDのときのジェノタイプ頻度とLEのときの差2008-06-25作ってみる。fHWDもLDも、SNPペアのジェノタイプの分布に従属性を発生させる要因である。LDは、1パラメタにて9ジェノタイプ全体に及ぶ依存関係を発生させる。HWDは、階層構造をなしており、個々のSNPについてヘテロとホモとの間のHWEからの乖離として定めら...作ってみる。controlのレビューを紹介した(記事はこちら)。その中で、構造化集団の構造化の程度をfで表し、それを用いて、集団のHWEから外れたジェノタイプ頻度の計算と、構成亜集団のアレル頻度のばらつき具合についての記載があった。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。