選抜方法と時期:第一回授業時に簡単なアンケートにて自己アピールをしてもらいます。配布資料などはSFC-SFSの授業ページで公開します。科目概要バイオテクノロジーの目覚ましい発展により、誰もが自分のゲノム−DNAで綴られた自らの設計図−を入手可能な時代が目前に迫って来ている。このような「パーソナルゲノム」は、基礎科学や医療・創薬などのみならず、極めて近い将来に倫理・経済・法などといったさまざまな社会システムに甚大な影響を与えることがもはや不可避である。本講義では、実際にパーソナルゲノムやバイオインフォマティクス(生物情報学)研究で活用されているソフトウェアを実習形式で実際に使いながら、実践的にゲノム解析を習得し、生命科学の方法を体験的に理解することを目的としている。授業シラバス主題と目標/授業の手法などDNAという生命の設計図を記録する分子の構造が明らかになってからわずか半世紀、そしてヒトゲノムが解読されてからまだたったの10年あまりですが、すでにヒトを含む数千種以上の生物の全遺伝情報であるゲノム配列が公開され、誰でも無料で簡単に入手することができます。そればかりか、今やDNAの配列を解読する装置の劇的な進歩により、1000人分のヒトの遺伝情報を解読するプロジェクトなどが国際的に進行しており、もはやゲノム情報は「手軽に」入手できるものになりつつあります。実際、最初のヒトゲノムは3000億円と13年の月日をかけて読まれましたが、ヒト一人のゲノムを読むコストは数年以内に10万円以下になると予想されています。コンピュータが部屋1つ分もの大きさがあり、特定の大学や研究所にしか存在しなかった時代から、誰もが手にする「パーソナルコンピュータ」になった今日、私たちの生活はインターネットに代表されるような情報化革命によって劇的に変貌を遂げました。同様に、誰もが自分のゲノムを手にする「パーソナルゲノム」の時代の幕開けが目前にせまる今日、医療や創薬はより個人に合わせたものになり、また治療よりも予防に重点がおかれるようになることで、バイオとゲノムによる革命が私たちの生活を激変させようとしています。パーソナルゲノムという《究極の個人情報》の存在はまた、極めて近い将来に倫理・経済・法などといったさまざまな社会システムに甚大な影響を与えるでしょう。本講義では、このような今目前に迫るパーソナルゲノム時代に向けて、実際にパーソナルゲノムとさまざまなバイオインフォマティクスのソフトウェアツールを使い解析を行いながら、私たち人間のゲノムに関する課題にアプローチします。履修者が興味のある形質や病気について、問題を発見するところから、解析を通して「答え」にたどりつくまでのプロセスをグループワークで経験し、パーソナルゲノム研究の実際を体験してもらいます。方法などグループワークの最終プレゼン、そして個人で提出するレポート、及び、毎回の授業での課題や発表などで評価します。基本的に最終プレゼンと個人レポートが評価対象になります。期末試験は行いません。履修上の注意グループワーク作業がメインになります。半期間に研究の流れを全て体験できますが、そのためには必然的に授業時間外に多くの時間を割いていただく必要があります。この授業を履修する場合は積極的に授業のために時間が割けるようにしてください。イントロダクション「パーソナルゲノム」の概要と授業の全体像を説明します。履修制限のためのアンケートを行います。パーソナルゲノムからわかること個人のゲノム配列から何がわかるのか、パーソナルゲノムにおける自分と他人との違いとは何か、などを、実際にデータや事例を交えながら紹介します。DNA配列の検索と比較ゲノムの「変異」を見つけるために、DNA配列を検索し、比較する方法を実習します。病気や形質などの表現型に関して調べたい場合、まずはその表現型に対応する遺伝子を知り、その生物学的知識を得なければなりません。「表現型」と「遺伝子」を結びつけるための調査方法を講義します。遺伝子のネットワーク遺伝子は基本的には1つだけではたらくわけではなく、細胞の中で複雑な遺伝子ネットワークをつくり、生命現象を形づくっています。このような遺伝子のネットワークを調べる方法を実習します。バイオインフォマティクスのソフトウェアツール遺伝子の解析にはさまざまなバイオインフォマティクスのソフトウェアツールを利用します。ここではグループ毎に、特に実際に解析で使うものを選択し、実際に目的に合わせて使いながら利点を調べます。中間発表これまでに行ってきたグループワークの成果を中間報告してもらいます。他のグループにも役に立つツールや、取り組む表現系関連する遺伝子などを紹介してもらいます。解析これまで調べてきた生物学的知識やツールを使って、実際にテーマとして設定した現象を調べてみましょう。解析これまで調べてきた生物学的知識やツールを使って、実際にテーマとして設定した現象を調べてみましょう。得られた結果から、どういう新しい発見があるのかを調べます。ここではまた生物学的知見のサーベイに取り組み、解析の結果がどういった意味や役割を持つのかを理解します。得られた結果から、どういう新しい発見があるのかを調べます。ここではまた生物学的知見のサーベイに取り組み、解析の結果がどういった意味や役割を持つのかを理解します。最終プレゼン準備グループワークの最終プレゼンの準備を行います。最終プレゼングループごとに成果を発表してもらいます。質疑応答には実際にゲノムの研究をしている学生などにも参加してもらう予定です。最終プレゼングループごとに成果を発表してもらいます。質疑応答には実際にゲノムの研究をしている学生などにも参加してもらう予定です。sfc.keio.ac.jp。