refinement)は,初期モデル(断片的な部分モデルも可)から水分子を拾うまでの,タンパク質分子構造精密化の過程を全自動で行うためのソフトウエアーである。Lafireは、まず、アミノ酸配列ファイルに基づいて、初期モデルの配列を確認し、必要ならばアミノ酸の置換を行なう。Fo-Fc)と大きくずれている部分の構造の構築を行う。次に、モデルと電子密度の一致度を1残基ずつ計算し、一致していない残基のフィッティングを行う。Lafireでは精密化は既存のソフトCNS或いはREFMAC5を利用している。精密化のモニター用にRfree/R因子のファイル、モデルのRamachandranプロット用ファイルを出力する。これらはグラフィックスプログラムLafire_moleviewにより,簡単に可視化することができる。自動精密化プログラムですね。変更履歴3.0aWinXP用パッケージが追加されています。integrated.アルファ版なので問題があれば連絡が欲しい、と書いてありました。(Linux)2.61これまでのバグフィックス。