新施設「ポケスロン」。コンテストのようにスピード、パワー、テクニック、スタミナ、ジャンプの能力がそれぞれのポケモンに設定されており、それを基にミニゲームを行う。ミニゲームは10種類。テツにボールにしてもらえる。各地にぼんぐりの木がある。みどぼんぐり:フレンドボール(ポケモンがなつきやすい)くろぼんぐり:ヘビーボール(重いポケモンが捕まえやすい)ももぼんぐり:ラブラブボール(異性のポケモンが捕まえやすい)しろぼんぐり:スピードボール(すばやさが高いポケモンが捕まえやすい)あかぼんぐり:レベルボール(自分よりレベルの低いポケモンが捕まえやすい)きぼんぐり:ムーンボール(月の石で進化するポケモンが捕まえやすい)あおぼんぐり:ルアーボール(釣ったポケモンが捕まえやすい)ぼんぐりは「ボンシェイカー」でポケスロン用のドリンク「ボンドリンク」にできる。「きのみプランター」できのみの栽培が可能。ジョウト地方に「バトルフロンティア」登場。内容はプラチナと同じ。コガネシティに「グローバルターミナル」。「GTS」や「バトルビデオ」がある。GB版にはなかった「サファリゾーン」追加。自分でエリアをカスタマイズできる。「虫取り大会」を開催。ポケモンLv45の「ホウオウ」「ルギア」両方をどちらのバージョンでもゲットできる。Lv40の「エンテイ」「スイクン」「ライコウ」をゲットできる。エンテイ、ライコウはジョウトを徘徊。HGで「カイオーガ」、SSで「グラードン」が出現。両方を集めると「レックウザ」出現。カントー地方に「ファイヤー」「サンダー」「フリーザー」「ミュウツー」「ラティアス(HG)/ラティオス(SS)」出現。ピカチュウカラーのピチューをHGSSに連れていくとギザみみピチューをゲットできる。技は「てだすけ」「ボルテッカー」「いばる」「いたみわけ」。劇場配布で手に入れた「アルセウス」を手持ちに入れて「シント遺跡」に行くとLv1の「ディアルガ」、「パルキア」、「ギラティナ」の内1匹をゲットできる。ディアルガはメタルバースト、パルキアはハイドロポンプ、ギラティナはかげうちをそれぞれ覚え、こんごうだま、しらたま、はっきんだまを持っている。ラジオを使用すると一部のシンオウ・ホウエンのポケモンが野生で出現。大量発生が日替わりになり一部のシンオウやホウエンのポケモンも追加。歩数計「ポケウォーカー」が同梱。DSと通信してポケウォーカーにポケモンを預けることが出来る。預けたポケモンは歩いた歩数によってレベルアップしたりなついたりする。歩数が増えると「ワット」が貯まるワットを使用して新しいコースが購入したりダウンジングやポケトレができる。友達とポケウォーカー同士で通信すると道具が貰える。