はじめにBASはバイオインフォマティクスの開発、解析をサポートするPerlモジュールのひとつです。このチュートリアルはBASを理解し、設定方法を示すものです。BASの設定方法それでは例をみていきましょう。以下は環境設定ファイルの内容になります。.G-languageでは10個のクラスと24個のメソッドが実装されています。解析するデータを選択するEscherichia_coli_K12がデフォルトのデータとして選択されています。他のデータを使用したい場合には、変数[gb1]を書き換える必要があります。下の例のように変数(例えば[mgen])を複数用意することも可能です。メソッドを選択するここでは、例としてcodonクラスのメソッド[codon_usage]を使用します。メソッドのスイッチをオンにするため[N]を[Y]に変更し、[G-instance]に解析するデータ(ここでは[mgen])を指定します。ファイルへ出力する場合には、[-output]のオプションに[f]を指定し、./mgen/に保存されます。同様に、グラフトとして出力する場合には[g]を指定し、./mgen/graphに保存されます。デフォルトでは[show]が指定されており、グラフを含むすべての結果が出力されます。-filename環境設定ファイルを保存し、BASファイルを実行します。以下が標準的な出力結果になります。.1.次に、出力された結果を見ていきましょう。グラフを描画する場合は以下のようにいます。ファイルを保存します。次に、BASを実行します。すると、ファイルが出力されます。以下が標準的な出力結果になります。注意点[Essential]と[option]には違いがあります。[option]には名称の前に[-]がつきます(例えば-CDSid)が、[Essential]にはつきません。[Essential]には変数を指定しますが、[option]にはしません。#[G-instance]は[Essential]になり、[-CDSid]、[-output]、[-output]、[-filename]は[option]になります。