「緑の地球」は任せとけ「地球が木星からきた蜥蜴と戦争するようになって一年。デビューさせたのがこれまでのお話。・・・」て、リルちゃんの適確な説明で始まる第2話です。かっこいいおもちゃは欲しくなる。優れた戦艦も欲しくなる。そんな訳でナデシコの性能を知った地球連合軍は、それを指揮下に組み入れようと企み、戦艦トビウメを差し向けます。それに呼応してムネタケがナデシコ艦内を制圧してしまいました。ユリカはクルーたちが反対するなか、連合軍との交渉に応じるかの様にトビウメに乗りこみます。実は天川明人の両親のことを尋ねるためでした。活性化したチューリップによって生じた混乱の隙に、ユリカたちはナデシコに帰艦。前後してムネタケらに拘束されていたクルーも自力で艦を取り戻し、明人はエステバリスでユリカを支援します。再起動したナデシコは、チューリップに自ら突入。のみ込まれる寸前にグラビティブラストを発射し、内部からの破壊に成功しました。目的地の火星に向かうのでした。敵を退けたナデシコは、スキャパレリ・プロジェクトに従い火星を目指して発進しようとしますが、地球連合軍はナデシコの戦果を知り、軍に編入しようともくろみます。人間関係を使った説得のため、ユリカの父であるミスマル・コウイチロウ提督とその艦隊をナデシコに向けて派遣します。ナデシコ艦長のユリカは、帰艦した天川明人の部屋に押しかけるのですが、そこで明人の両親の死について問い詰められてしまうのでした。している内に、主要クルーに呼集がかかり、一同は艦橋に集まります。プロスペクターたちからナデシコの目的地が火星であることを知らされるのですが、そこにムネタケが武装した連合軍士官と共に艦橋に押しかけ、ナデシコの指揮権の譲渡を要求するのでした。ユリカは、その要求を呑むかのようにナデシコのマスターキーを抜き、父コウイチロウの艦へと向かいます。それはアキトの両親の死について父に問うためでした。残されたクルーらは食堂に監禁されます。このシチュエーションに一人盛り上がり、皆を励ます(アジる)山田は、なぜかゲキガンガー3の上映を始めます。皆のしらけた雰囲気の中、なぜか明人はゲキガンガーに感化され、「この状況の中どうにかする事が大事ではないか」と考え、監視の兵士を倒してエステバリスで出撃しました。ユリカの方は、ナデシコがネルガルの所有物で軍の下にはつかないことが明確になり、コウイチロウが天河明人の両親の死について知らないことを確認できたことから、ナデシコへの帰艦の途につきます。ナデシコのクルーたちも自力で状況を打破。艦の制御を取り戻すために行動に出ます。外では敵の無人兵器基地「チューリップ」が出現。地球連合軍の艦艇2隻を呑み込んでしまいました。ユリカを迎えに出撃した明人ですが、エステバリスが陸戦用であったため、海面と海中を行ったり来たりするだけ。このまま何も出来ずに海の底?でもユリカは明人が(第一話につづいて)またも自分のために頑張っていると勘違いして感激します。クルーらの活躍でナデシコ艦橋もムネタケらから取り戻されました。ゴート、リルが艦橋に到着するのと時を同じくしてユリカとプロスペクターも到着しました。再起動したナデシコに、ユリカはチューリップに向けての前進を指示します。囮としての任務?を無事に果たした明人は、相変わらず海上と海中を行き来するだけ?と思いきや、ガイ機が登場。彼の空中戦用フレームとの換装で沈没の危機を免れます。チューリップの触手を薙ぎ払い、ナデシコの戦闘準備が整うまでの時間を稼ぐのでした。ナデシコはチューリップに向けて突撃を続行。チューリップに呑み込まれるか?という時に主砲のグラビティ・ブラストで内部から敵を粉砕。地球連合軍を振り切って宇宙へと向かうのでした。話と同じ陸戦用エステバリス。前話ではそれなりに活躍したのですが、海上での行動には無理があるようです。空戦用フレームの装着で機動力の確保はできたのですが、空中換装は・・・運んで来た側のコクピットが犠牲になってしまいました。多用途機なのでしょうが、運用には事前の準備が必要なのですね。BURNING」をBGMに進んでいきます。旗艦の捨て身の体当たりで、敵チューチップのユートピアコロニーの市街部への落下は防がれたのですが、敵無人兵器の襲撃で地下シェルターに避難した人たちは次々と倒されていきます。主人公の天河明人は単身で無人兵器に立ち向かいますが、誰も救えず自身も絶体絶命の危機に陥ります。絶叫する主人公は眩い光に包まれ、次に現れたときは地球でした。舞台は1年後の地球に移ります。敵の支配圏は火星をのみ込み月にまで達します。日々の戦闘が地表で行われる事態に対し、民間企業であるネルガル重工はスキャパレリ・プロジェクトを発動しました。地球でコックをめざしていた天河明人は、偶然から再開した幼なじみのミスマル・ユリカを追って、ネルガル重工の地下ドックに向かい新造戦艦・ナデシコに乗り込むことになるのでした。襲い来る敵を振り払い、新鋭戦艦ナデシコは、癖のあるメンバーを載せ、火星を目指して飛び立つのでした。木星連合の支配地域が月に及び、地球が戦場になる事態。そんな状況下で、ネルガル重工は火星を奪還する為のスキャラパレリプロジェクトを発動。ナデシコ級一番艦ナデシコの建造と並列してクルーの招集を始めます。重役連中からプロジェクトマネージャー役を命じられたゴート・ホーリーとプロスペクター(本名不明)は、マッドメカニックのウリバタケ・セイヤ、元社長秘書のハルカ・ミナト、声優のメグミ・レイヤード、遺伝子操作により生まれた天才少女ホシノ・ルリそして地球連合提督ミスマル・コウイチロウの一人娘で大学における戦略シミュレーションで負けなしのミスマル・ユリカらを集めるのでした。誰も彼も一癖も二癖もあるけど能力は一流の逸材(変わり者)たちでした。1年前の火星会戦に巻き込まれ、どういう訳か、現在サセボの食堂でコックをしている明人。火星における木連側の無人兵器の虐殺を目の当たりにした彼は、上空で行われる戦闘ですら恐怖のため体が震えてしまうのでした。状態に食堂をクビになってしまった彼は、偶然ユリカと出会います。会った時には彼女を思い出せなかった明人ですが、ユリカが落とした幼い頃の写真を見て彼女を思い出します。全力疾走の末、ネルガルの警備員に取り押さえられた明人はプロスペクターからナデシコの厨房で働くよう誘われ、なし崩しにクルーとして乗り込むことになったのでした。新しい職場であるナデシコとドックを散策していた明人は、搭載される機動兵器エステバリスを目にします。パイロットのダイゴウジ・ガイは、はしゃいでエステバリスで暴れた結果、足を骨折してしまいます。ガイからゲキ・ガンガー3の超合金を取ってくれと頼まれた明人はコクピットに入りますが、そこに適の無人兵器・バッタ、ジョロ軍団が襲来します。ナデシコの火力で地表の部隊ごと吹き飛ばすことを主張するウリタケに対し、ユリカはエステバリスを囮とする作戦を立案。明人が乗るエステバリスが敵の包囲網に突入。訳が分からず恐怖に陥る明人でしたが、ユリカの激励で奮起。囮として疾走し、さらにワイヤード・フィストをぶち込んで渡り合うまでに至ります。ナデシコはその雄姿を海上に現し、必殺のグラビティ・ブラストで敵を一掃するのに成功しました。なんとか任務を果たした明人でしたが、その行為から、ユリカに好意を寄せていると勘違いされてしまいます。一癖も二癖もあるクルーとの作戦(生活)が始まろうとしています。明人とそしてナデシコの前途はいかに......?と思ってしまうのでした。