塩基配列を検索できるサービスは、他にもBLASTやBLATなどがありますが、これらはいずれも10塩基以上の配列でないと検索できません。いう技術を使って高速に検索できるのが特徴です。検索したい配列と、どのデータベースに対して検索するのかを選びます。検索を実行すると、このように高速に結果が返ってきます。それぞれはUCSCゲノムブラウザにリンクしています。下にスクロールすると、結果をダウンロードできます。次に、UCSCゲノムブラザを使って、結果を可視化する方法を紹介します。先程の画面、BEDファイルを指定して、出てきたページのURLをコピーしておきます。Tracksをクリックします。コピー済みのBEDファイルのアドレスを貼り付け、ゲノムバージョンをGGGenomeと同じものを選択してsubmitをクリックします。今回の場合は、1塩基のミスマッチを許しているので、9万箇所の該当する領域が見つかりました。(黒いバーがヒットしたところです)。ゲノムスケールを拡大縮小したり、目的の領域を検索するなどして結果をいろいろ見てみるといいでしょう。転写産物の高速検索ゲノムだけではなく、転写産物に対しても検索することができます。GGGenomeのデータベースには、代表的な転写産物データベースであるRefSeqもあるので、それを選択して配列を検索するだけです。使うという方法もあります。GGGenomeと同じようにして転写産物を対象とした検索ができます。関連サイト・図書この記事に関連した内容を紹介しているサイトや本はこちらです。https://youtu.be/TsF3Y8yEv3kリンクまとめ最後に今回の内容をまとめます。ポータルサイト】生命医学をハックするをお読みいただきありがとうございました。生命科学研究は、研究手法が大きく前進したこととコンピューターの発達なども相まって、かつてないほどの勢いで知識の整備が進んでいます。ない方や、未来を担う学生さんに向けた情報発信をしています。2週間に1回のペースで、サイトの更新情報や、それらをまとめた解説記事をニュースレターとして発行しています。メールアドレスの登録は無料で、もちろんいつでも解除することができます。サイト名の「ハックする」には、分かってきたことを駆使し、それを応用して、病気の治療や研究などにさらに活用していこうという意味があります。糖尿病のインスリン治療薬や、その他の注射薬について、その種類や副作用、なぜ効くのか、そして注射の注意点など、知っておきたい事をまとめました。assembly法などの重要な技術が開発されました。薬局にはたくさんのアレルギーの薬がおいてありますが、実は大きく「第1世代」と「第2世代」に分かれていることは知らない方が多いと思います。第2話の今回は、2次元でデータを格納する行列について見ていく。【その他のタンパク泳動方法も】タンパク質の電気泳動には、SDS-PAGEが最もよく使われています。多くの生物は痛みを引き起こす物質を作ることによって危険を伝えている。両親の遺伝情報が子供に受け継がれるはずなのに、兄弟姉妹で同じ人はいませんね。今回の記事では、この謎についてみていきましょう。ついても、学術論文を生命科学トップのCell関連誌に筆頭著者として掲載。目指す学生の方に向けてお届けします。@biomedicalhacksサイトの記事をもとに加筆した月2回のニュースレターもメールで好評配信中。医学・生命科学の総合メディア。バイオテクノロジー・データサイエンス、研究留学を中心に発信。