ウインドウの階層構造と同一です。その部分はあえて表示を行なっておりません。ウインドウと使い分けを行なってください。設定ファイルは、どこに保存されますか?各プロジェクトの、「(プロジェクトフォルダ)/Yae/」の場所に保存されます。フォルダや設定ファイルが存在しない場合には、自動的に作成されます。フォルダを除外フォルダに指定しておいてください。画面写真には、ユニティちゃんの素材を使用させていただいています。