住民税の特別徴収ですよね。役所から未納付の通知は届いていないのでしょうか。通常特別徴収通知と納付額が異なる場合は役所から通知があると思います。未納でも過納でもです。給与台帳の預り金と特別徴収台帳との確認をされずに納付台帳に沿った納付をされているのでしょうか。あれば預り金が一致しなくなります。預り金の台帳ではどうなのか。預かっていないだけであれば本人から徴収する必要があります。今年度分と徴収漏れの分と合わせて徴収しましょう。その際には今年度分は通常の住民税蘭での控除、不足分は別控除欄で今年度とは分けて徴収しましょう。徴収しない場合は課税給与として支給処理が必要になります。