知識で、生まれたばかりでも分かるようになります。以下の写真はすべて生まれてから24時間以内のものです。メスメスには、女性の部分にとても特有な「Y」形状が見られます。3つのラインが交差する下位部分で、皮膚が内側にくいこんでいます。これがメスであるサインです。オスオスにもY型があります。オスの場合、皮膚は内側にくいこんでいません。Y型の周りの皮膚は赤らんでおり、Y型上部部分が突起していることもあります。3つのラインが交差してY型(尿道)が形成される上に、小さな点があります。赤ちゃん自体が小さいので、簡単には見つかりません。写真では見えませんが、Y型の上を優しく押すと、突起物(ペニス)がより突き出します。メスの場合では、同個所を軽く押しても、Y型の形状は変わりません。有毛ギニアピッグの雄雌判別はスキニーギニアピッグよりも、毛が邪魔になるため難しいです。体の体形は同様で、判別する部分は同じです。メス同様に、Y型上部の内側のくぼみを探します。女性部分の少し上をやさしく押しても、変化はほとんど見られません。オスY型上部に注視して、赤らんでいるか、突起している(内側へのくぼみではない)皮膚部分、又は尿道である小さな点を探してください。誕生から数日たつまでは、オスの赤ちゃんの雄雌判別はとても難しいですが、オス・メスの部分の上をやさしく押すことで、性別ごとに大きな違いが見えます。