それは、大気を操るクェイサーの称号。アトミスの一人であるアデプトの酸素使い・朽葉悠は、鉄や銅を操る金属使いにとっては最悪の天敵だ。彼を兄に持つ葵が、サーシャを頼って山辺邸に身を寄せる。まふゆは、葵とサーシャの間にあるただならぬ雰囲気にやきもき。彼らもまたクェイサーを生み出すため、非人道的な「儀式」を日夜繰り返していた。聖ミハイロフ学園に、鳳が臨時講師として赴任してきた。恩人との思わぬ再会に、喜びが隠せないまふゆ。学園に転入したリジーと共に歓迎会へ招待したところ、なぜかサーシャの機嫌がすこぶる悪い。新たな敵のクェイサーが、華の前に現れて...。燈の父であり、孤児だった自分を育ててくれた、まふゆの敬愛する「おじ様」。サルイ・スーの生神女の手がかりをつかむため、まふゆは美由梨と共に山辺の別荘を訪れる。列車の旅にはしゃぐ美由梨に呆れつつも、まふゆの緊張は解けない。燈を守るため、自分が頑張らなければいけないのだ。別荘への道すがら、二人はアデプトのクェイサーに襲われ、離ればなれになってしまう。クェイサーたちが探し求める伝説の聖像(イコン)「サルイ・スーの生神女」。その隠し場所は誰も知らない。差し押さえられた山辺の別荘を調べるため、辻堂家主催ロシア秘宝展の間、コンパニオンガールとして働くことになったまふゆたち。美由梨は、燈やサーシャまでもを従わせることができてご満悦。そんな彼女を、おバカさんねと笑うカーチャ。サーシャのマリアとして戦闘時は常に付き従っているが、普段の生活や生い立ちは全て謎に包まれている。尋ねるまふゆに、サーシャは興味が無いと言い放つ。彼にとっては、聖乳(ソーマ)を得るための存在にすぎないのだ。異端のクェイサーたちが集う組織アデプトから、新たな敵のクェイサーが送り込まれる。アデプト12使徒・ガスチェンバー、塩素を操る浄化者クロアだ。その排除を命じられたサーシャたちだったが、因縁の相手を前にテレサが立ちすくんでしまう。カーチャに弱味を握られてしまった華。彼女は必死に自分の本性を否定しようとするが、カーチャの言葉にどうしても抗えない。まふゆたちは、街で買い物をする。燈の護衛のため、サーシャやテレサも一緒だ。女性の失踪事件を耳にするが、まふゆの関心はバーゲンセール。彼はオーリャに手をかけ、サーシャに復讐心を植えつけた最強の敵。彼との邂逅を果たしたサーシャは、幼い頃の夢にうなされる。そんなサーシャを癒すのは燈だ。オーリャに似た優しい雰囲気に、サーシャは唯一心を許す。サーシャとの共同生活は、慌しくも楽しい日々。まふゆは彼の非常識な言動に振り回されつつも、次第に昔の笑顔を取り戻していく。美由梨と華は、新たな留学生であるカーチャを迎え入れる。その妖精のような容貌に、華の心はかき乱され......。どこかに隠されているという伝説の聖像(イコン)「サルイ・スーの生神女」。それを巡るクェイサーたちの闘い。まふゆを襲ったマグネシウムは、自分や燈のことを知っていた。まふゆは事情を聞くべくサーシャを問いただすが、彼は関係ないと突っぱねる。放課後、山辺邸にクラスメイトの文奈が燈の見舞いにやってくる。彼女は燈たちを気遣ってくれる数少ない友人の一人であり、学園で起こっている異変に気づき始めていた。そこへ再びマグネシウムが襲いかかり、文奈が連れ去られてしまう。マグネシウムに立ち向かうまふゆ。それは、女性から聖乳(ソーマ)と呼ばれる生体エネルギーを得ることで、特定元素を自在に操る特殊能力者。聖ミハイロフ学園に通う織部まふゆと山辺燈は、クラスでいじめに遭っていた。戸惑いや悲しみを胸に秘め、それでも笑顔を絶やさない燈に、まふゆは自分が燈を守らなければという思いを強くする。そんな彼女たちの前に、ある日、サーシャという謎の少年が現れる。その出会いが全ての始まりだった。まりあ、山根希美オロチ計画をめぐり、激しく意見が対立する重桜内部。夜桜の下で加賀は一人、赤城と天城との過去に思いをはせていた。謎の悪夢に苛まれるエンタープライズは、幻想の中で天城と、自らに似た形をした謎の存在と対峙する。入中が壁を変化させて“個性”を消せる相澤を狙うが、ファットガムと切島が身代わりとなって、別の部屋に落ちていった。そこで待っていたのは戦闘狂の乱波とバリアの“個性”を持つ天蓋だった。迎え撃つ切島だが、乱波のすさまじいパワーで安無嶺過武瑠(アンブレイカブル)を破られてしまう。「俺はまた何もできねえのかよ...」今の自分と中学時代の出来事を重ねてしまう切島。一丸となって進めてきたケータイ作りも、遂にゴール!現代戦最強の武器・ケータイを手に入れた!クロムたちが実際に声が届くかテストする中、ルリから発せられた“スピーカー”という単語に違和感を持った千空。起こった不運に全員が戸惑う。驚き、焦り、不安などから溢れ出すネガティブな言葉...。勝利への強い願いを持ってメンバーを奮い立たせる晋吾...“勝利の舞い”で気合を入れた。...いよいよメンバーにとって、運命の日がやってくる。それぞれの思惑をのせ、暗殺された首相の国葬の車列が走る。葬儀を強行するレイ・ドーン。それを狙い、妖精兵を率い襲撃をかけるウルフラン。