src/browser/atom-window.coffee。constructorの中を以下のように編集する。してもいいが、バグがでやすくなるので注意。./script/buildビルドが終わるまでしばし時間がかかるので待機。2.7.6などで対処。アイコンの色はキレイな青色。作るなり、編集するなりすればOK。background-colorでは透過できないところもあったので、そこはopacityを設定しています。下記の画像のようにできました。