ቅዱስ ሲኖዶስ ሚያዝያ 21 ቀን 2002 ዓ.ም. ባደረገው መደበኛ ስብሰባ ብፁዕ አቡነ ፊልጶስ ለሦስት ዓመታት የመንበረ ፓትርያርክ ጠቅላይ ጽ/ቤት ኾነው እንዲሠሩ ተደርጓል፡፡ በዚኽ ከፍተኛ ሓላፊነታቸው፣ በቤተ ክርስቲያን ተጠግተው በሥራ አጥነት የሚቸገሩትን አቅም በፈቀደ መጠን ሥራ እንዲያገኙ በማድረግ የመምሪያ እና የድርጅት ሓላፊዎች ጋር በመተባበር የዋና ሥራ አስኪያጅነት ታላቅ ሓላፊነታቸውን በምስጋና አጠናቀዋል፡፡
