ತಮ್ಮ ತಂದೆಯವರ ಬೆಂಗಾಲಿ ಚಿತ್ರ ಬಿಯರ್ ಫೂಲ್' " (1992) ರಲ್ಲಿ ಮೊದಲ ಬಾರಿಗೆ ಕ್ಯಾಮೆರಾದ ಮುಂದೆ ಚಿಕ್ಕ ಪಾತ್ರ ಅಭಿನಯ ಮಾಡಿದ ನಂತರ, ಮುಖರ್ಜಿಯವರು ರಾಜಾ ಕಿ ಆಯೇಗಿ ಬರಾತ್ " (1997) ರಲ್ಲಿ ಮುಖಂಡಳಾಗಿ ಐದು ವರ್ಷಗಳ ನಂತರ ನಟನೆಯ ಮೊದಲ ಪ್ರವಾಶವನ್ನು ಮಾಡಿದರು. ಆ ಚಲನಚಿತ್ರದಲ್ಲಿ ಒಬ್ಬ ಅತ್ಯಾಚಾರದ ಬಲಿಪಶುವಾಗಿ ಅವರ ಅಭಿನಯವು ಚೆನ್ನಾಗಿ ಜನಮನ್ನಣೆ ಗಳಿಸಿತು, ಆದರೆ ಆ ಚಿತ್ರವು ವ್ಯಾವಹಾರಿಕವಾಗಿ ನೆಲಕಚ್ಚಿತು. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಅವರು ಸ್ಟಾರ್ ಸ್ಕ್ರೀನ್ ಪ್ರಶಸ್ತಿಗಳಲ್ಲಿ ವಿಶೇಷ ತೀರ್ಪುಗಾರರ ಮನ್ನಣೆ ಗಳಿಸಿದರು. ಆದರೆ, ಗಲ್ಲಾ ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯಲ್ಲಿ ಚಿತ್ರವು ಸೋತು ಹೋದಾಗ ಅವರು ತಮ್ಮ ವಿದ್ಯಾಭ್ಯಾಸವನ್ನು ಮುಗಿಸಲು ಕಾಲೇಜಿಗೆ ಹಿಂದಿರುಗಿದರು.
ಮುಖರ್ಜಿಯವರು 1998 ರ ಘುಲಾಮ್" ' ಚಲನಚಿತ್ರದಲ್ಲಿ, ಅಮೀರ್ ಖಾನ್ ವಿರುದ್ಧ ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಹಿಂದಿರುಗಿದರು; ಆ ಚಲನಚಿತ್ರವು ಗಲ್ಲಾ ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯಲ್ಲಿ ಅದ್ಭುತ ಯಶಸ್ಸನ್ನು ಕಂಡು ಜಯಗಳಿಸಿತು. ಆತಿ ಹೈ ಖಂಡಾಲಾ' " ಎಂಬ ಹಾಡು ಅಧಿಕ ಜನಮನ್ನಣೆ ಗಳಿಸಿ ಮುಖರ್ಜಿಯವರಿಗೆ ಜನಪ್ರಿಯತೆ ಗಳಿಸಿಕೊಟ್ಟಿತು, ಇದರಿಂದ ಅವರು "ಖಂಡಾಲಾ ಹುಡುಗಿ " ಎಂಬ ಅಡ್ಡ ಹೆಸರು ಪಡೆದರು. ಕರಣ್ ಜೋಹರ್ ರವರ ಮೊದಲ ನಿರ್ದೇಶನದ ಚಲನಚಿತ್ರ ಶಾರುಖ್ ಖಾನ್ ಹಾಗೂ ಕಜೋಲ್ ಅವರ ಜೊತೆ ಸಹ ನಟನಾ ಚಿತ್ರ "ಕುಚ್ ಕುಚ್ ಹೋತಾ ಹೈ" , ಆ ವರ್ಷ ಅವರನ್ನು ಹಿಂಬಾಲಿಸಿತು. ಆ ಚಲನಚಿತ್ರವು ಅದ್ಭುತ ಯಶಸ್ಸನ್ನು ಕಂಡಿತು, ಹಾಗೂ ಅವರು "ಅತ್ಯಂತ ಶ್ರೇಷ್ಠ ಪೋಷಕ ನಟಿ ಪ್ರಶಸ್ತಿ " ವಿಭಾಗದಲ್ಲಿ ತಮ್ಮ ಮೊದಲ ಫಿಲ್ಮ್ ಫೇರ್ ಪ್ರಶಸ್ತಿಯನ್ನು ಪಡೆದರು.

ಅವರು ಅನೇಕ ಚಲನಚಿತ್ರಗಳಿಗೆ ಸಹಿ ಹಾಕುವುದರ ಮೂಲಕ ತಮ್ಮ ವೃತ್ತಿ ಜೀವನವನ್ನು ಹಿಂಬಾಲಿಸಿದರು. ದುರಾದೃಷ್ಟಕ್ಕೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಚಲನಚಿತ್ರಗಳು ಗಲ್ಲಾ ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯಲ್ಲಿ ಯಶಸ್ಸನ್ನು ಕಾಣಲಿಲ್ಲ. 2000 ದರಲ್ಲಿ ತೆರೆ ಕಂಡ "ಬಾದಲ್" ಅತ್ಯಂತ ಹೆಚ್ಚು ಹಣ ಗಳಿಸಿದ ಚಿತ್ರವಾದರೂ, ಅವರು ಆ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಉದ್ಯಮದಲ್ಲಿ ತಮ್ಮ ಅಂತಸ್ಥನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸುವಲ್ಲಿ ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಲಿಲ್ಲ.

2001 ರಲ್ಲಿ, ಮುಖರ್ಜಿಯವರು ಸಲ್ಮಾನ್ ಖಾನ್ ಮತ್ತು ಪ್ರೀತಿ ಜಿಂಟಾ ರವರ ಜೊತೆ, ಅಬ್ಬಾಸ್ ಮಸ್ತಾನ್ ಅವರ ಪ್ರಣಯ ಪ್ರಸಂಗದ ಚಲನಚಿತ್ರ "'ಚೋರಿ ಚೋರಿ ಚುಪ್ಕೆ ಚುಪ್ಕೆ" ' ಚಿತ್ರದಲ್ಲಿ ಸಹ ನಟಿಯಾಗಿ ನಟಿಸಿದರು. ಆ ಚಲನಚಿತ್ರವು ಒಂದು ವರ್ಷ ತಡವಾಗಿ ಬಿಡುಗಡೆಯಾಯಿತು, ಮತ್ತು ಬಾಡಿಗೆ ತಾಯಿ ಹಾಗೂ ಮಗುವಿನ ಜನನ ವಿಷಯವನ್ನು ಕೈಗೆತ್ತಿಕೊಂಡ ಬಾಲಿವುಡ್ ನ ಮೊದಲ ಚಿತ್ರಗಳಲ್ಲೊಂದಾಗಿತ್ತು. ಗರ್ಭಪಾತದ ನಂತರ ಗರ್ಭ ಧರಿಸಲು ಅಶಕ್ತಳಾದ ಒಬ್ಬ ಮಹಿಳೆಯು ಬಾಡಿಗೆ ತಾಯಿಯನ್ನು ಪಡೆದ ಪ್ರಿಯಾ ಮಲ್ಹೋತ್ರಾರ ಪಾತ್ರವನ್ನು ಮುಖರ್ಜಿಯವರು ನಿರ್ವಹಿಸಿದರು. ರೆಡ್ ಇಫ್.ಕಾಂ ಬರೆದಿತ್ತು "ದುಃಖಿಸುವುದು ಹಾಗೂ ಬಿಕ್ಕಿ ಅಳುವುದನ್ನು ಬಿಟ್ಟರೆ ಅವರಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಉತ್ತೇಜನ ನೀಡದ ಒಂದು ಪಾತ್ರದಲ್ಲಿ ರಾಣಿ ಮುಖರ್ಜಿಯವರು ಪ್ರತಿ ಬಂಧಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದ್ದಾರೆ. ಅವರ ಖ್ಯತಿಗೆ ತಕ್ಕಂತೆ ಅವರು, ಒಬ್ಬ ಸ್ಥಿರವಾದ ಸರ್ವೇಸಾಮಾನ್ಯ ತ್ಯಾಗಮಯಿ "ಭಾರತೀಯ ನಾರಿಯ " ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸಿದ್ದರೂ, ತಮ್ಮ ಸ್ವಂತಿಕೆಯನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಿಲು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿದ್ದಾರೆ".

2002 ರಲ್ಲಿ, ಹೃತಿಕ್ ರೋಶನ್ ಮತ್ತು ಕರೀನಾ ಕಪೂರ್ ರವರ ಜೊತೆ ಕುನಾಲ್ ಕೊಹ್ಲಿಯವರ ಪ್ರೀತಿ ಪೂರ್ವಕ ಚಲನಚಿತ್ರ ಮುಝಸೆ ದೋಸ್ತಿ ಕರೋಗೆ" ' ನಲ್ಲಿ ಮುಖರ್ಜಿಯವರು ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರದಲ್ಲಿ ಸಹ ನಟಿಯಾಗಿ ನಟಿಸಿದರು. ಆ ಚಲನಚಿತ್ರವು ಭಾರತದಲ್ಲಿ ಅಷ್ಟಾಗಿ ಯಶಸ್ಸನ್ನು ಕಾಣದಿದ್ದರೂ, ಹೊರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಅದು ಅತ್ಯಧಿಕ ಹೆಚ್ಚು ವ್ಯಾಪಾರವನ್ನು ಗಳಿಸಿತು, ಹಾಗೂ ಭಾರತದ ಅತ್ಯಂತ ದೊಡ್ಡ ನಿರ್ಮಾಣ ಸಂಸ್ಥೆ, ಯಶ್ ರಾಜ್ ಫಿಲಮ್ಸ್ ನಲ್ಲಿ ಪ್ರವೇಶವನ್ನು ಪಡೆದರು. ಮುಂದೆ ಆ ವರ್ಷದಲ್ಲಿ, ಮುಖರ್ಜಿಯವರು ವಿವೇಕ್ ಓಬೆರಾಯ್ ಅವರ ವಿರುದ್ಧ ವಿಮರ್ಶಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಯಶಸ್ಸು ಕಂಡ ಶಾದ್ ಅಲಿಯವರ ಸಾಥಿಯಾ" ' ದಲ್ಲಿ ಅಭಿನಯಿಸಿದರು. ಚಿಕ್ಕ ವಯಸ್ಸಿನಲ್ಲೇ ಮದುವೆಯಾಗಿ ಒತ್ತಡಗಳು ಹಾಗೂ ಅತೃಪ್ತಿಯನ್ನು ಎದುರಿಸುವ ಒಬ್ಬ ವೈದ್ಯಕೀಯ ವಿದ್ಯಾರ್ಥಿ ಸುಹಾನಿ ಶರ್ಮಾಳ ಪಾತ್ರವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಿ, ಅವರು ಅತ್ಯಂತ ಶ್ರೇಷ್ಠ ಅಭಿನಯಕ್ಕಾಗಿ ಫಿಲ್ಮ್ ಫೇರ್ ವಿಮರ್ಶಕರ ಪ್ರಶಸ್ತಿಯನ್ನು ಪಡೆದರು, ಹಾಹೂ ಇತರ ಅನೇಕ ಚಲನಚಿತ್ರಗಳಿಗೆ ನಾಮನಿರ್ದೇಶನದ ಜೊತೆಗೆ, ಫಿಲ್ಮ್ ಫೇರ್ನಲ್ಲಿ ಮೊದಲ ಅತ್ಯುನ್ನತ ನಟಿ ಪ್ರವೇಶವನ್ನು ಅವರು ಗಳಿಸಿದರು. "ಬಿಬಿಸಿ " ಯಿಂದ ಮಣಿಶ್ ಗುಜ್ಜರ್ ಅವರು ಸೂಚಿಸಿದರು, "...ರಾಣಿ ಮುಖರ್ಜಿ... ಹೆಚ್ಚಿನ ದೃಢ ಸಂಕಲ್ಪದಿಂದ ಒಬ್ಬ ಮಧ್ಯಮ ವರ್ಗೀಯ ಹುಡುಗಿಯ ಪಾತ್ರದಲ್ಲಿ ಅದ್ಭುತವಾಗಿ ನಟಿಸಿದ್ದಾರೆ."

ಹಿಂದಣ ಕೆಲಸ ಮತ್ತು ಅದ್ಭುತ ಯಶಸ್ಸು1997-2002
ಆರಂಭಿಕ ಜೀವನ ಮತ್ತು ಹಿನ್ನೆಲೆ
ಇತರೆ ಸಾಧನೆಗಳು
ಸಮೂಹ ಮಾಧ್ಯಮಗಳಲ್ಲಿ