আওরঙ্গজেবের দীর্ঘ সম্রাট জীবনে প্রথম বহুল আলোচিত দণ্ডাদেশ ছিল তার ভাই শাহজাদা দারাশিকো কে মৃত্যুদণ্ড প্রদান। হিন্দুত্ববাদের দিকে ঝুঁকে পড়ার জন্য তাকে এই দণ্ডাদেশ দেয়া হয়েছিল যদিও অনেকের মতে এর পিছনে রাজনৈতিক কারণ ছিল। অঙ্গ যে তার ভাই শাহজাদা মুরাদ বক্স কে নর হত্যার দায়ে মৃত্যুদণ্ড প্রদান করেছিলেন। আওরঙ্গজেবের বিরুদ্ধে তার বন্দি ভ্রাতুষ্পুত্র সোলাইমান শিখন কে বিষ প্রয়োগে হত্যা করার অভিযোগ উঠেছিল।

১৬৮৯ সালে আওরঙ্গজেব দ্বিতীয় মারাঠা ছাত্রপতি (রাজা) সম্ভাজিকে অত্যন্ত নির্মম মৃত্যুদণ্ড প্রদান করেন। এটি সাজানো মামলায় বিহারের বুরহনপুর এর মুসলিমদের বিরুদ্ধে হত্যাকাণ্ড পরিচালনা এবং সন্ত্রাসের দায়ে তাকে মৃত্যুদন্ডে দন্ডিত করা হয়।

১৬৭৫ সালে শিখ নেতা গুরু তেজ বাহাদুর কে আওরঙ্গজেব এর নির্দেশে গ্রেফতার করা হয়। ধর্ম অবমাননার দায়ে দোষী সাব্যস্ত হবার পরে তাকে মৃত্যুদন্ডে প্রদান করা হয়। আওরঙ্গজেবের আমলে গুজরাটের সুবাহদার কে প্রচলিত ধর্মীয় বিশ্বাসের অবমাননা করার জন্য মৃত্যুদন্ডে দন্ডিত করা হয়।

কর নীতি
ইসলামি আইনের প্রবর্তন
মুঘল মারাঠা যুদ্ধ
বিরোধীদের দমন