তৎকালীন সময়ে তাদের পরিবারে শম্ভুনাথের কাকা শিক্ষিত ব্যক্তি ছিলেন। কাকার অনুপ্রেরণায় শম্ভুনাথ বিদ্যালয়ে ভর্তি হন। গরিবাটি উচ্চ বিদ্যালয় থেকে তিনি ডিস্টিংশন সহ ম্যাট্রিকুলেশন পাশ করেন। মাধ্যমিকে কৃতিত্বের সাথে উত্তীর্ণ হওয়ায় তিনি হুগলী মহসিন কলেজে পড়বার জন্যে বৃত্তি পান। উচ্চ মাধ্যমিকেও তিনি তার কৃতিত্বের সাক্ষর রাখেন এবং ফলস্বরূপ কলকাতা মেডিকেল কলেজে পড়বার সুযোগ পান এবং ডি. পি. আই. বৃত্তি লাভ করেন। সেই সময়ে তাদের পরিবারে আর্থিক অনটন শুরু হলে সেই সময়কার কলকাতার একজন ধনাঢ্য ব্যবসায়ী কে সি শেঠ তাঁকে সাহায্য করেন। তাঁর আর্থিক সাহায্যে ও ব্যক্তিগত স্কলারশিপে শম্ভুনাথ ১৯৩৫ খ্রিস্টাব্দে কলকাতা মেডিকেল কলেজে ভর্তি হতে সক্ষম হন।
মেডিকেল কলেজে ভর্তি হওয়ার প্রথম থেকেই মেধাবী ও ধীরস্থির প্রকৃতির শম্ভুনাথ শিক্ষকদের নজর কাড়তে সক্ষম হন এবং রোগবিদ্যা বিভাগে অনুজীব বিজ্ঞানের অধ্যাপক ও শিক্ষক মণীন্দ্রনাথ দে’র স্নেহের পাত্রে পরিণত হন তিনি। ফলে আর্থিক দিক থেকে দুই পরিবারের মধ্যে বৈষম্য থাকলেও তিনি তাঁর কন্যা তরুবালা দেবীর সঙ্গে শম্ভুনাথের বিয়ে দেন। ১৯৩৯ খ্রিস্টাব্দে শম্ভুনাথ এম. বি. এবং ১৯৪২ সালে ট্রপিক্যাল চিকিৎসাবিদ্যায় ডিপ্লোমা ডিগ্রি অর্জন করেন।

নোবেল ফাউন্ডেশন সম্মেলন ও পরবর্তী জীবন
গবেষণা
শিক্ষাজীবন
কলেরা রোগ-সংক্রমণ পদ্ধতি