বিবর্তনের স্বপক্ষে জৈব-রাসায়নিক প্রমাণের অন্যতম ধ্রুপদী উদাহরণ হল, সমস্ত জীবন্ত কোষে সাইটোক্রোম সি প্রোটিনের (সমস্ত জীবন্ত কোষে প্রোটিনটি থাকে কারণ জীবনের একদম বুনিয়াদি ক্রিয়া-কলাপ এটি সম্পন্ন করে) প্রকরণ উপস্থিত থাকা। বিভিন্ন জীবে সাইটোক্রোম সি এর যে প্রকরণ; তা পরিমাপ করা হয় অ্যামাইনো এসিডের সংখ্যার তারতম্যের উপর। এই যে অ্যামিনো এসিডের ভিন্নতা; তা পরিব্যক্তির কারণে বেস পেয়ারের পরিবর্তনের ফলে সৃষ্ট হয়। একটি বেসপেয়ার প্রতিস্থাপন এর ফলাফলের দরণ প্রত্যেক অ্যামিনো এসিড ভিন্ন হয় বলে অনুমান করা হয়। সাইটোক্রোম সি জিনের বেসপেয়ার কখন পরিবর্তিত হয়ে দুইটি প্রজাতি ভিন্ন হয়, সে হিসেব করা যায়। উদাহরণস্বরূপ, যদি সাইটোক্রোম সি জিনের একটি বেস পেয়ার পরিবর্তিত হতে গড়পরতায় "ক" বছর লাগে এবং মানুষ এবং বানরের সাইটোক্রম সি জিনের বেস পেয়ারে সে ভিন্নতাটি দেখা যায়; তবে এই মানুষ এবং বানর গোত্রীয় প্রজাতি একে অপর থেকে ক বছর পূর্বে পৃথক হয়ে গিয়েছিল।

সাইটোক্রোম সি-এর যে প্রাথমিক গঠন; তা ১০০ টি অ্যামাইনো এসিড নিয়ে একটি চেইন বা শৃংখল হিসেবে গঠিত হয়। উচ্চশ্রেণীর প্রজাতিতে এই শৃংখল টি ১০৪টি অ্যামাইনো এসিড নিয়ে গঠিত হয়।

বিবর্তনীয় জীববিজ্ঞানে সাইটোক্রোম স্ত্রী খুবই গুরুত্বপূর্ণ আলোচনার বিষয়বস্তু। মানুষ আর শিম্পাঞ্জির ক্ষেত্রে মাইটোকণ্ড্রিয়ার প্রোটিন সাইটোক্রম সিতে (মাইটোকণ্ড্রিয়াতেই এই প্রোটিন পাওয়া যায়) প্রাপ্ত অ্যামিনো এসিডের অনুক্রম একদম একই। রেসাস বানরের ক্ষেত্রেও প্রায় একই; শুধুমাত্র ৬৬ নাম্বার অ্যামিনো এসিডের ক্ষেত্রে একটু ভিন্নতা দেখা যায়। মানুষের ৬৬ নং অ্যামিনো এসিড আইসোলিউসিন; রেসাস বানরের থ্রিওনিন। মুরগী আর তুর্কি পাখি গুলো একই অনুক্রম শেয়ার করে। গরু, ভেড়া, শুকরও একই অনুক্রম শেয়ার করে। 

সাইটোক্রম সি-এর হোমোলোগাসে এরকম মিল থাকা, সাধারণ পূর্বপুরুষ এর স্বপক্ষের প্রমাণ কে পোক্ত করে। অ্যামাইনো এসিড এর কনফিগারেশনে যদি ভিন্নতা তৈরি হয় তবে তা প্রোটিনটির কার্যপ্রণালীতে খুব বেশি প্রভাব ফেলে না। এ থেকে বোঝা যায় বেশ পেয়ারের এ প্রতিস্থাপন সুনির্দিষ্ট কোনো নকশার অংশ নয় বরং এলোমেলো পরিব্যক্তির ফসল।

অধিকন্তু, সাইটোক্রোম বি এর ক্রমবিন্যাস এর অনিত্যতার জন্য একে সাধারণত মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএর অংশ হিসেবে ব্যবহার করে জীবের মধ্যে জাতিজনি সম্পর্ক স্থাপন করা হয়। পরিবার এবং গোত্রের মধ্যে সম্পর্ক স্থাপনে একে খুবই গুরুত্বপূর্ণ হিসেবে বিবেচনা করা হয়। সাইটোক্রোম বি নিয়ে নিয়ে যেসব তুলনামূলক গবেষণা গুলো করা হয়েছে; তার ফলে নতুন শ্রেণিবিন্যাসের নকশা প্রণয়ন করা হয়েছে এবং এর ফলে নতুন বর্ণনাকৃত প্রজাতিকে সহজে কোন গোত্রে পরবে তা নিরুপম করা যায় এবং বিবর্তনীয় সম্পর্ক আরো গভীরভাবে অনুধাবন করা যায়।

শহরে বন্যজীবন
পিপার্ড মথের বিবর্তন
সাইটোক্রম সি এবং বি
এন্ডোজেনাস রেট্রোভাইরাস