প্রতিষ্ঠানটিতে হাউজ প্রথা চালু আছে। তবে সকল প্রাতিষ্ঠানিক কার্যক্রমে এর প্রচলন নেই। বিদ্যালয়ের প্রতি শ্রেণি ও শিফট মিলিয়ে একটি শ্রেণির জন্য মোট ৪টি শাখা চালু আছে। তবে প্রাথমিক শ্রেণির শিক্ষার্থীদের জন্য শ্রেণিপ্রতি ২টি শাখা চালু আছে।

তাই মূলত হাউজ প্রথা শুধু খেলাধুলাতেই দেখা যায়। ইনডোর গেমস ও বার্ষিক ক্রীড়া প্রতিযোগিতায় ছাত্ররা ৪ টি হাউজে ভাগ হয়ে খেলায় অংশ নেয়। হাউজগুলো হলোঃ

মুক্তিযুদ্ধে ময়মনসিংহ জিলা স্কুল
হাউজ প্রথা
খ্যাতিমান শিক্ষকবৃন্দ
শিক্ষা সুবিধাসমূহ