হিন্দুরা, প্রধানত দক্ষিণে, হিন্দুধর্ম পালন করে থাকে। ভূটানের আশ্রমের অধ্যক্ষ জে খেনপু কর্তৃক ২০১২ এ থিম্পুতে হিন্দুদের প্রথম মন্দির প্রতিষ্ঠিত হয় এবং হিন্দুরা ছোট থেকে মাঝারি দলে বিভক্ত হয়ে নিজেদের ধর্ম পালন করে থাকে। হিন্দুধর্ম নেপালি নৃতাত্ত্বিক দলগুলো কর্তৃক পালন করতে বেশি দেখা যায়, যদিও নৃতাত্ত্বিক দলগুলোর অধিকাংশরাই বৌদ্ধ ধর্ম পালন করে থাকে।

হিন্দু ধর্ম
ধর্ম পালনে স্বাধীনতা এবং নিয়ন্ত্রণ
ইসলাম
বৌদ্ধ ধর্ম