এটি একটি দ্বীপ দেশ হওয়াতে ফেরি পরিষেবাগুলি পরিবহনের একটি গুরুত্বপূর্ণ মাধ্যম। বড় বড় কার্গো জাহাজ থেকে শুরু করে ছোট পাম্প বোট পর্যন্ত অনেক ধরনের নৌযান ব্যবহৃত হয়। কিছু ভ্রমণ বড় রাত্রিকালীন ফেরিতে এক বা দুই দিনের জন্য স্থায়ী হয় যেমন যারা "২গো ট্রাভেল" দ্বারা ভ্রমন করে, অন্য ভ্রমণগুলি ১৫ মিনিটেরও কম সময় স্থায়ী হতে পারে, যেমন যারা খোলা আকাশ পাম্প নৌকাগুলি দ্বারা ইলোইলো স্ট্রেট অতিক্রম করে।

ফিলিপাইনে অসংখ্য শিপিং সংস্থা রয়েছে। উল্লেখযোগ্য কোম্পানিগুলোর মধ্যে অন্তর্ভুক্ত ২গো ট্রাভেল (সুপারফেরি এবং নিগ্রোস নেভিগেশন এর উত্তরসূরি) এবং ট্রান্স-এশিয়া শিপিং লাইনস।

ফেরি সেবা
বিমান পরিবহন
সড়ক
বিমানবন্দর