ചില സൂക്ഷ്മജീവികളുടെ സാന്നിധ്യമോ, സൂക്ഷ്മജീവികളുടെ എണ്ണത്തിലുണ്ടാകുന്ന വ്യത്യാസമോ പലതരം രോഗങ്ങൾക്കും കാരണമാകുന്നു. 20 ശതമാനത്തോളം ക്യാൻസറുകൾ മനുഷ്യശരീരത്തിലെ സൂക്ഷ്മജീവികളുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു. ചെറുകുടലിൽ ഉള്ളതിന്റെ പത്തുലക്ഷം ഇരട്ടി ബാക്ടീരിയകൾ വൻകുടലിൽ ഉള്ളതും വൻകുടലിൽ കോളൻ ക്യാൻസറിന്റെ സാധ്യത ചെറുകുടലിനെക്കാൾ 12 ഇരട്ടിയുള്ളതും വൻകുടലിലെ സൂക്ഷ്മജീവികളുടെ പ്രാധാന്യം വർദ്ധിപ്പിക്കുന്നു. 

രോഗങ്ങൾ
ശ്വാസകോശം
ബാക്ടീരിയ
സൂക്ഷ്മജീവികളുടെ എണ്ണം