അണുബാധ ശ്വസനവ്യവസ്ഥയുടെ ഏത് ഭാഗത്തെയും ബാധിക്കും. 

സൈനസൈറ്റിസ്, ടോൺസിലൈറ്റിസ്, ഓട്ടിറ്റിസ് മീഡിയ, ഫറിഞ്ചിറ്റിസ്, ലാറിഞ്ചൈറ്റിസ് എന്നിവ അപ്പർ ശ്വാസകോശ അണുബാധയായി കണക്കാക്കപ്പെടുന്നു. 

ശ്വാസകോശത്തിലെ അണുബാധയാണ് ന്യൂമോണിയ, സാധാരണയായി ബാക്ടീരിയകൾ മൂലമാണ് ഉണ്ടാകുന്നത്, പ്രത്യേകിച്ച് "സ്ട്രെപ്റ്റോകോക്കസ് ന്യുമോണിയ" . ന്യുമോണിയയുടെ ഒരു പ്രധാന കാരണമാണ് ക്ഷയം . വൈറസ്, ഫംഗസ് തുടങ്ങിയ മറ്റ് രോഗകാരികൾ ന്യുമോണിയയ്ക്ക് കാരണമാകും. ഉദാഹരണത്തിന് സിവിയർ അക്യൂട്ട് റെസ്പിറേറ്ററി സിൻഡ്രോം, ന്യുമോസിസ്റ്റിസ് ന്യുമോണിയ എന്നിവ. ന്യുമോണിയ മൂലം, ശ്വാസകോശത്തിലെ കുരു, അണുബാധ മൂലമുണ്ടാകുന്ന ശ്വാസകോശത്തിലെ വൃത്താകൃതിയിലുള്ള അറ, അല്ലെങ്കിൽ പ്ലൂറൽ അറയിലേക്ക് പടരുക തുടങ്ങിയ സങ്കീർണതകൾ ഉണ്ടാകാം. 

മോണരോഗങ്ങളിൽ നിന്നുള്ള ബാക്ടീരിയകൾ വായുമാർഗങ്ങളിലൂടെ ശ്വാസകോശത്തിലേക്കും സഞ്ചരിക്കുമെന്ന് പുതിയ ഗവേഷണങ്ങൾ സൂചിപ്പിക്കുന്നു. 

തടസ്സപ്പെടുത്തുന്ന ശ്വാസകോശരോഗം
ശ്വസനപഥ അണുബാധ
മുഴകൾ
നവജാത ശിശുക്കളിലെ രോഗങ്ങൾ