অন্তর্নিহিত মোডে, পুরো FTPS সেশনটি এনক্রিপ্ট করা হয়েছে। সুস্পষ্ট মোডের মধ্যে পার্থক্য রয়েছে. যে সংযোগের কোন ক্ষেত্রগুলি এনক্রিপ্ট করতে হবে তার উপরে ক্লায়েন্টের পুরো নিয়ন্ত্রণ রয়েছে। এফটিপিএস নিয়ন্ত্রণ চ্যানেল এবং এফটিপিএস ডেটা চ্যানেলের জন্য এনক্রিপশন সক্ষম ও অক্ষম করা যে কোনও সময় হতে পারে। একমাত্র বিধিনিষেধটি এফটিপিএস সার্ভার থেকে আসে, যা সার্ভার এনক্রিপশন নীতিের উপর ভিত্তি করে আদেশগুলি অস্বীকার করার ক্ষমতা রাখে।

অন্তর্নিহিত
পরিবহন স্তর সুরক্ষা (টিএলএস) / সুরক্ষিত সকেট স্তর (এসএসএল)
সুবিধা
ব্যবহারের সুযোগ