একাডেমির সভাপতিত্বে একজন চেয়ারম্যান রয়েছেন এবং তিনি পাকিস্তান সরকার সংস্কৃতি, ক্রীড়া ও যুব বিষয়ক মন্ত্রণালয়ের একজন উপদেষ্টা হিসাবে কাজ করেন। পাকিস্তানের রাষ্ট্রপতি পৃষ্ঠপোষক এবং পাকিস্তানের প্রধানমন্ত্রীর প্রেসিডেন্ট, অন্যদিকে সংস্কৃতি মন্ত্রীর সহ-সভাপতি হলেন সহকারী প্রেসিডেন্ট এবং সংস্কৃতি মন্ত্রণালয়ের সচিব হলেন একাডেমির নির্বাহী প্রধান।

একাডেমির পরিচালনা পর্ষদের একটি বোর্ড রয়েছে এবং সুষ্ঠুভাবে পরিচালনার জন্য নির্বাহী কমিটির সিদ্ধান্ত গ্রহণের ক্ষমতা রয়েছে। এতে একজন পূর্ণকালীন পরিচালক গবেষক রয়েছেন, যিনি একাডেমির প্রশাসনিক প্রধানও বটে।

২০১১ সালে পাকিস্তানের স্বাধীনতা দিবসের ছয় দিন পরে ২০ই আগস্ট কায়েদ-ই-আজম একাডেমি পাকিস্তান সৃষ্টিতে মোহাম্মদ আলী জিন্নাহের অবদান সম্পর্কে প্রচারের জন্য "পাকিস্তান কি যাদ-ও-জুহদ-ই-আজাদী" নামক অনুষ্ঠানের আয়োজন করেছিল।

প্রশাসন
ইতিহাস
গ্রন্থাগার
কায়েদ-ই-আজম দলিলাদি