১৫ আগস্ট ১৫৬১ তারিখে, স্কটল্যান্ডে রানী মেরির আগমনের ঘোষণা দেওয়ার জন্য লেথে কামান দাগা হয়। পাঁচ দিন পরে হোলিরুড প্রাসাদে রাজকীয় চ্যাপেলে গণপরিষদের উদযাপনকালে তিনি তার প্রতিবাদকারীদের একজনকে জোর করে তোলার প্রতিবাদ জানান। পরের দিন তিনি ঘোষণা দেন যে, ধর্মের বর্তমান অবস্থাতে কোন পরিবর্তন হবে না এবং তার বান্দাদেরকে নিন্দা করা বা বিরক্ত করা উচিত নয়। অনেক মহীয়সী এটি গ্রহণ করেন, কিন্তু নক্স না। পরের রবিবার, তিনি সেন্ট গিলস এর পিল্পিট থেকে প্রতিবাদ করেন। ফলস্বরূপ, তার প্রত্যাবর্তনের মাত্র দুই সপ্তাহ পরে মেরি নক্সকে ডেকে পাঠালেন। তিনি তার মা ও তার নিজের কর্তৃত্বের বিরুদ্ধে একটি বই লেখার বিরুদ্ধে বিদ্রোহকে উত্তেজিত করার অভিযোগ করেন। নক্স উত্তর দেন যে যতদিন তার বিষয়গুলি তার শাসনকে সহজতর মনে করে ততদিন তিনি তার শাসন গ্রহণ করতে রাজি ছিলেন, তিনি উল্লেখ করেছিলেন যে পৌল প্রেরিত নিরোর শাসনের অধীনে বসবাস করতে ইচ্ছুক ছিলেন। মেরি উল্লেখ করেছেন যে, তিনি মহিলা শাসনের নীতির বিরুদ্ধে লিখেছিলেন। তিনি প্রতিক্রিয়া ব্যক্ত করেন যে, তাকে যে কোনও ক্ষতি না করে তাকে বিরক্ত করা উচিত নয়। মেরি যখন তাকে জিজ্ঞেস করলেন যে, তাদের শাসককে বিরোধিতা করার অধিকার কি ছিল, তখন তিনি উত্তর দিয়েছিলেন যে, যদি সাম্রাজ্যরা তাদের বৈধ সীমা অতিক্রম করে, তবে তারা এমনকি জোর দিয়েও বিরোধিতা করতে পারে।

১৩ডিসেম্বর ১৫৬২তারিখে মেরি আবারো নক্সকে ডেকে পাঠালেন, তিনি কিছু বিশেষ অনুষ্ঠানকে অস্বীকার করেছিলেন, যা নক্সের সংস্কারের ব্যয় হিসাবে আনন্দিত করেছিলেন। তিনি অভিযোগ করেছিলেন যে নক্স তার কন্যাকে অবমাননাকর বলে অভিহিত করার জন্য রানীকে অযৌক্তিকভাবে কথা বলেছিলেন। নক্সের বক্তব্যের ব্যাখ্যা দেওয়ার পর মেরি বলেন যে তিনি নক্সকে মতামতের পার্থক্যের জন্য দোষারোপ করেননি এবং বলেন যে তিনি ভবিষ্যতে সরাসরি তার কাছে আসেন যদি তিনি তার পছন্দমত কিছু শুনে থাকেন। তার বন্ধুত্বপূর্ণ অঙ্গভঙ্গি সত্ত্বেও, নক্স উত্তর দেন যে তিনি তার বক্তৃতাগুলিতে তার দৃঢ় বিশ্বাসের কথা শুনবেন এবং তার উপর অপেক্ষা করবেন না।

১৫৬৩ সালে ইস্টারের সময়, আয়ারশায়ারের কিছু যাজক গণ দিনটিকে উদযাপন করেছিলেন, এভাবে আইনটি অস্বীকার করেছিলেন। কিছু প্রোটেস্ট্যান্ট এই পুরোহিতদের গ্রেফতার করে নিজেদের আইন প্রয়োগ করার চেষ্টা করেছিল। তখন মেরি তৃতীয়বারের জন্য নক্সকে ডেকে পাঠানোর পরামর্শ দেন। তিনি নক্সকে ধর্মীয় গতিবেগ বৃদ্ধির জন্য তার প্রভাব ব্যবহার করতে বলেন। তিনি তাদের কর্ম রক্ষা করেছিলেন এবং উল্লেখ করেছিলেন যে তিনি আইনগুলি মেনে চলার জন্য আবদ্ধ ছিলেন এবং যদি তিনি না করতেন তবে অন্যরা হতো। মেরি স্বীকার করে নক্সকে অবাক করে দিয়েছিলেন যে পুরোহিতদের বিচারের সম্মুখীন করা হবে।

মেরি এবং নক্সের মধ্যে সর্বাধিক নাটকীয় সাক্ষাত্কার ১৫৬৩ সালের ২৪ জুন অনুষ্ঠিত হয়।মেরি স্পেনের ফিলিপ দ্বিতীয় পুত্র ডন কার্লোসের প্রস্তাবিত বিয়ের বিরুদ্ধে প্রচার করছেন বলে শুনে নক্সকে হ্যালোরুডকে ডেকে পাঠালেন। মেরি নক্সকে ঠাট্টা করে শুরু করলেন, তারপর তিনি অশ্রুতে ফেটে পড়লেন। "আমার বিয়ের সাথে কি করতে হবে?" তিনি জিজ্ঞেস করলেন, "এই কমনওয়েলথের মধ্যে আপনি কি?" "ম্যাডামের মধ্যে জন্মগ্রহণকারী একটি বিষয়," নক্স উত্তর দেন। তিনি উল্লেখ করেছিলেন যে যদিও তিনি মহৎ জন্মের অধিকারী ছিলেন না, তবুও তিনি রাজ্যের বিপদগুলির বিষয়ে সতর্কতার জন্য কোনও বিষয় হিসাবে একই দায়িত্ব পালন করেছিলেন। মেরি আবার কাঁদতে লাগলেন, তিনি বললেন, "মাদাম, আমি ঈশ্বরের উপস্থিতিতে কথা বলি: আমি ঈশ্বরের কোন সৃষ্টির কান্নায় কখনও আনন্দিত নই; হ্যাঁ, আমি আমার নিজের ছেলেদের অশ্রু খুব ভালভাবে মুছতে পারি না, যার হাতে আমার নিজের হাত সংশোধন করা হয়।তিনি আরও বলেন, তিনি বরং তার অশ্রু সহ্য করতে চান, তবে, নীরব থাকার চেয়ে আমার মতে কমনওয়েলথকে বিশ্বাসঘাতকতা করা ভাল "। তখন মেরি তাকে রুম থেকে বের করার আদেশ দেন।

মেরির সাথে নক্সের চূড়ান্ত সাক্ষাৎ হলিউডের একটি ঘটনার দ্বারা উত্থাপিত হয়েছিল। ১৫৬৩ সালে গ্রীষ্মকালীন অগ্রগতি এডিনবার্গ থেকে মেরি অনুপস্থিত ছিলেন, গণ জনতা উদযাপনের সময় জনতা তার ব্যক্তিগত চ্যাপেলে যাওয়ার পথে বাধ্য হন। বিক্ষোভের সময়, পুরোহিতের জীবন হুমকির মুখে পড়েছিল। ফলস্বরূপ, এডিনবার্গের বার্গেসেসের দুইটি রঙ্গক, ১৫৬৩ সালের ২৪ অক্টোবর বিচারের জন্য নির্ধারিত হয়। এই পুরুষদের রক্ষার জন্য নক্সে নেতাদের আহ্বান জানিয়ে চিঠি পাঠিয়েছিলেন। মেরি এই চিঠিগুলোর একটি পেয়েছেন এবং তার উপদেষ্টাকে জিজ্ঞেস করেছিলেন, যদি এটি কোনও জঘন্য কাজ না হয়। স্টুয়ার্ট এবং মাইটল্যান্ড, কির্ক ও রানী উভয়ের সাথে ভাল সম্পর্ক রাখতে চাইলে নক্সকে জিজ্ঞেস করলেন, তিনি ভুল ছিলেন এবং বিষয়টি শান্তভাবে নিষ্পত্তি করতে বললেন। নক্স অস্বীকার করে তিনি মেরি এবং প্রিভি কাউন্সিলের সামনে নিজেকে রক্ষা করেছিলেন। তিনি যুক্তি দিয়েছিলেন যে তিনি কির্কের একজন মন্ত্রী হিসাবে তার দায়িত্বের অংশ হিসাবে আইনি, অবৈধ নয়, সমাবেশ করেছিলেন। তিনি চলে যাওয়ার পর কাউন্সিলররা তাকে রাষ্ট্রদ্রোহিতার অভিযোগে অভিযুক্ত করার পক্ষে ভোট দেন।

নক্স এবং রানী মেরি(১৫৬১-১৫৬৪)
জেনেভা থেকে ফ্রাঙ্কফুর্ট এবং স্কটল্যান্ড (১৫৫৪-১৫৫৬)
স্কটল্যান্ডের সংস্কার (১৫৬০-১৫৬১)
এডিনবার্গের শেষ বছরগুলো(১৫৬৪-১৫৭২)