একটি তত্ত্বাবধায়ক সরকার ভারপ্রাপ্ত প্রধানমন্ত্রী মালিক মেরাজ খালিদেরঅধীনে গঠন করা হয় এবং ১৯৯৭ সাধারণ নির্বাচন হয়। লেগারি দ্বিতীয় মেয়াদে মনোনয়ন চাইলেও সংসদে পিপিপির হতাশার কারণে তার পুনঃনির্বাচিত হওয়ার সম্ভাবনা হ্রাস পায়। 

চৌদ্দ ও পঞ্চদশ সংশোধনী বিলের বিরুদ্ধে আপিলের শুনানি করার সিদ্ধান্ত নেওয়ার সময় প্রধান বিচারপতি শাহ এবং প্রধানমন্ত্রী শরীফের মধ্যে সমস্যা আরও বেড়ে যায় এবং ১৯৯৭ সালে পিএমএল (এন) পক্ষ শাহের আদালতে আক্রমণ করেছিল। রাষ্ট্রপতি লেগারি এই বিষয়ে প্রধান বিচারপতি শাহের সমর্থনে হস্তক্ষেপের চেষ্টা করেছিলেন কিন্তু প্রধানমন্ত্রী শরীফ রাষ্ট্রপতি লেগারির বিরুদ্ধে অভিশংসন আন্দোলন আনার সিদ্ধান্ত নেওয়ার সময় লেগরীর পক্ষে তা আরও খারাপ হয়। ১৯৯৭ সালের ২ ডিসেম্বর রাষ্ট্রপতি লেঘারি সম্ভাব্য অভিশংসন এড়ানোর জন্য রাষ্ট্রপতি পদ থেকে পদত্যাগ করেন এবং একই বছর প্রধান বিচারপতি শাহও পদত্যাগ করেন। 

যখন তিনি মিল্লাত পার্টিকে পেয়েছিলেন তখন তিনি রাজনীতিতে সক্রিয় জড়িত হওয়ার পরিচয় দেন যেটি ২০০২ সালে অনুষ্ঠিত সাধারণ নির্বাচনে অংশ নিতে জাতীয় জোট নামে পরিচিত সাতটি দলের জোটে প্রবেশ করেছিল। রাষ্ট্রপতি পারভেজ মোশাররফ সমর্থিত পিএমএল (কিউ) এর সাথে জোট হিসাবে সরকার গঠনের জন্য জাতীয় জোট জাতীয় পরিষদে পর্যাপ্ত আসন অর্জন করেছিল। ২০০৪ সালে তিনি নিজের দল ছেড়ে পিএমএল (কিউ) এ যোগ দেন এবং মন্ত্রিপরিষদের সদস্য হওয়ার সাথে তার পুত্র আওস লেগারীকে সমর্থন করেন। তার বড় ছেলে জামাল লেগারি পিএমএল (কিউ)-এর হয়ে সিনেটের সদস্য নির্বাচিত হয়েছিলেন।

২০০৩-এ, পিপিপি-র সমালোচনার জবাব দেওয়ার সময় আচরণ বিধি লঙ্ঘন করা হলে তিনি প্রধানমন্ত্রী ভুট্টোকে বরখাস্ত করেছিলেন বলে কথিত আছে। 

সিভিল সার্ভিস এবং রাজনীতি
পদত্যাগ
জীবনী
পাকিস্তানের রাষ্ট্রপতি