এতবড় আঘাতের পরেও বামিয়ানে আবার কয়েকদশক পরে বসতি স্থাপিত হয়। তৈমুর বংশীয়দের শাসনকালে (১৩৭০ - ১৫০৭ খ্রিঃ) আমরা জানতে পারি উপত্যকায় আবার একটি শহর গড়ে উঠেছে। বাবরনামাতেও একাধিকবার একটি সুন্দর স্থান ও জেলার প্রশাসনিক কেন্দ্র হিসেবে এই উপত্যকা ও শহরের উল্লেখ পাওয়া যায়। তবে ততদিনে প্রাচীন রেশম পথ ধরে আন্তর্জাতিক বাণিজ্য কমে আসায় বামিয়ান শহর ও উপত্যকার পক্ষে আগেকার সমৃদ্ধি ফিরে পাওয়া আর সম্ভব ছিল না। ফলে একটি ছোট আঞ্চলিক কেন্দ্র হিসেবেই এরপর থেকে এই শহর অবস্থান করতে থাকে।
সপ্তদশ শতকের মুঘল নথিতে, বিশেষ করে আওরঙ্গজেবের সময় আমরা আবার বামিয়ানের উল্লেখ দেখতে পাই। সে' সময় ৫৫ মিটার উঁচু বড় বুদ্ধমূর্তিটিকে লক্ষ্য করে মুঘল গোলন্দাজরা কামান দাগা অভ্যেস করত। অষ্টাদশ শতাব্দীতে নাদির শাহের সেনারাও মূর্তিদুটিকে একইভাবে কামান দাগা অভ্যেসের চাঁদমারি হিসেবে ব্যবহার করত বলেও জানতে পারা যায়। এর ফলে মূর্তিদুটির শিল্পসৌকর্যের অপূরণীয় ক্ষতি হয় বলে পরবর্তীকালের পর্যটকদের বিবরণ থেকে আমরা জানতে পারি। পূর্বের শিল্পীত সৌন্দর্য নষ্ট হয়ে যাওয়ায় তাদের অনেকের কাছেই মূর্তিদুটি অনাকর্ষণীয় ও ছাঁদবিহীন বলে মনে হতে থাকে। উদাহরণস্বরূপ বিংশ শতাব্দীর প্রথমদিকের ইংরেজ পর্যটক ও লেখন রবার্ট বায়রনের বর্ণনা এখানে উল্লেখ করা যেতে পারে। ১৯৩৩ সালে তিনি তার "দ্য রোড টু অক্সিয়ানা" গ্রন্থে লিখেছেন - ১৮২০'র দশক থেকে আধুনিক বিদেশি পর্যটকরা বামিয়ানে আসতে শুরু করেন। ১৮২৩ সালে আসেন মুরক্রফট, ১৮৩২'এ চার্লস ম্যাসন, আলেকজাণ্ডার বার্নস ও মোহনলাল, ১৮৩৩'এ আসেন উড। এঁদের চোখ দিয়েই এই উপত্যকা ও তার ঐতিহাসিক নিদর্শনগুলি আধুনিক পৃথিবীর কাছে একরকম পুনরাবিস্কৃত হয়। তাদের বিবরণ থেকে আমরা জানতে পারি, বামিয়ান তখন একটি দেওয়ালে ঘেরা ছোট্ট শহর (এমনকী মোহনলাল তাকে নেহাত গ্রাম বলে উল্লেখ করেছেন)। শহরের অধিকাংশ বাড়িই দোতলা কিন্তু নিচু। বিশাল বুদ্ধমূর্তিদুটি খোদাই করা পাহাড়টির ঠিক গোড়ায় এর অবস্থান। শহরের অধিবাসীদের এক উল্লেখযোগ্য অংশ পাহাড়ের গায়ে কাটা গুহাগুলিতেই বাস করে। তবে উপরের দিকে কাটা প্রাচীন গুহাগুলিকে বসবাসের উদ্দেশ্যে তখনও পুনর্দখল করা হয়নি।

প্রাচীন ইতিহাস
বামিয়ান উপত্যকার ঐতিহাসিক নিদর্শনসমূহ
পুনর্বসতি স্থাপন ও আঞ্চলিক গুরুত্ব
কৃষি ও অর্থনীতি