লীগ ও কংগ্রেস নেতাদের সম্মতিতে ৩ জুনের পরিকল্পনার (মাউন্টব্যাটেন প্ল্যান) অনুসারে, সিদ্ধান্ত নেওয়া হয়েছিল যে ব্রিটিশ ভারত থেকে উত্পন্ন দুটি নতুন আধিপত্যের মধ্যে সীমানা স্যার সিরিল র‌্যাডক্লিফের নেতৃত্বে একটি সীমানা কমিশন দ্বারা নির্ধারিত হবে। পাঞ্জাব ও বেঙ্গল আইনসভাগুলো দেশভাগের পক্ষে সিদ্ধান্ত নেয় এবং মুসলিম সংখ্যাগরিষ্ঠ জেলা পাকিস্তানের আধিপত্যের একটি অংশ গঠন করে। সীমান্ত প্রদেশ এবং সিলেটে তাদের ভাগ্য নির্ধারণের জন্য একটি গণভোট অনুষ্ঠিত হয়েছিল। পুরো আসামে গণভোট অনুষ্ঠিত না হওয়ায় আলী ও ভাসানী হতাশ হয়েছিলেন এবং এর প্রতিবাদে ভাসানী গণভোট থেকে নিজেকে বিচ্ছিন্ন করেন। তবে, কারাগার থেকে মুক্তি পাওয়ার পরে তিনি সিলেট গণভোটের দিকে মনোনিবেশ করেছিলেন এবং জনগণ পূর্ববাংলা প্রদেশের সাথে এই জেলাটিকে একীভূত করার পক্ষে সিদ্ধান্ত নিয়েছিল। আলী জেলা থেকে দুটি থানা বাদ দেয়ায় হতাশা প্রকাশ করেছিলেন।

বাংলা ভাষা আন্দোলন
সিলেট গণভোট
পাকিস্তান (১৯৪৭–১৯৭১)
নিখিল ভারত মুসলিম লীগ