আইফোন ৫এস মুক্তির পর এর নানা হার্ডওয়্যার সমস্যা দেখা যায়। তবে ফোনের লেভেল সেন্সর কয়েক ডিগ্রী নেড়ে যাওয়ার ব্যাপারটি ব্যাপকভাবে দেখা যায়। যার কারণে ফোনের কম্পাস, এক্সেলারমিটার এবং জাইরোস্কোপ ভুলভাবে কাজ করে। বলা হয় এটি একটি হার্ডওয়্যার ভিত্তিক সমস্যা। 
কিছু লোক অন্যান্য সমস্যাও পেয়েছেন। যেমনঃঅতিরিক্ত গরম হয়ে যাওয়া, হঠাৎ রিস্টার্ট ও স্ক্রিন নীল হয়ে যাওয়া, ফোন নাড়ালে পাওয়ার বাটনে অদ্ভুত শব্দ, আইটিউনে কেনার জন্য টাচ-আইডির কাজ না করা। এগুলোর মধ্যে কিছু সমস্যার সমাধান সফটওয়্যার উন্নতিকরণে পাওয়া যায়।

ক্যামেরা
সমস্যা
গ্রহণযোগ্যতা
অ্যাপল পণ্যসামগ্রী