"লিটারেচার এন্ড কালচার অব পিস" নামক আন্তর্জাতিক ফোরামের আমন্ত্রণে তেল আবিবতে একটি সেমিনারে অংশ নেওয়ার সময় সালাহ উদ্দিন শোয়েব চৌধুরীকে ২০০৯ সালের ২৯ শে নভেম্বর গ্রেপ্তার করা হয়েছিল। ২০০৩ সালে তাকে রাষ্ট্রদ্রোহ, রাষ্ট্রদ্রোহী ও নিন্দার অভিযোগে অভিযুক্ত করা হয়েছিল। ২০০৪ সালের ২৪ শে জানুয়ারী বিমানবন্দর থানার ওসি মোহাম্মদ আবদুল হানিফের বিরুদ্ধে মামলা দায়ের করা নথির ভিত্তিতে মোসাদ এজেন্ট বলে দাবি করা হয়েছিল। ২০০৩ সালের ১ ডিসেম্বর দ্যা ডেইলি স্টার এর প্রতিবেদনে বলা হয়, পুলিশ তাকে গ্রেফতার করার সময় তার কাছে একটি প্রজেক্ট প্রোফাইল পাওয়া যায়, যাতে তিনি ইসরাইলের কাছে তিনটি দৈনিক পত্রিকা প্রকাশের জন্য ১২ কোটি টাকা সাহায্যের আবেদন করেছিলেন। তিনি তার আবেদনে ইসরাইলী বন্ধুদের মুসলিম প্রধান দেশে মিডিয়া গড়ে তোলার জন্য আহ্বান জানিয়ে বলেন, ‘"কোটি কোটি ডলার খরচ করে যুদ্ধবিমান ক্রয়ের চেয়ে মিডিয়া সৃষ্টি করুন, এতে ইসরাইল বেশি লাভবান হবে।"’ তিনি এসব তথ্য নিয়ে তেল আবিবে একটি সেমিনারে যাওয়ার চেষ্টা করছিলেন। পুলিশ তার বিরুদ্ধে রাষ্ট্রদ্রোহের মামলা করে। ২০১৪ সালের ৯ ই জানুয়ারী তিনি ঢাকার একটি আদালত বাংলাদেশের দন্ডবিধির ৫০৫ (এ) ধারায় দণ্ডিত হয়েছিলেন। 

২০১১ এর মার্চ মাসে, রুট অ্যান্ড ব্রাঞ্চ অ্যাসোসিয়েশনের প্রতিষ্ঠাতা ও সভাপতি আরেহ জোসেফ গ্যালিন, যে একটি অলাভজনক দল যা ইস্রায়েল ও অন্যান্য জাতির মধ্যে সহযোগিতা প্রচার করে, চৌধুরীকে তার ইসলাম-ইস্রায়েল ফেলোশিপ থেকে বহিষ্কার করেছে এমন রিপোর্ট প্রকাশিত হওয়ার পরে যে " আবেগগতভাবে দুর্বল একক ইহুদি মহিলা "কয়েক হাজার ডলারের মধ্যে। 

২০১২ সালের ৭ নভেম্বর, ঢাকার আদালত চৌধুরীর ব্যবসায়িক অংশীদার বাংলাদেশ স্টাডিজ ইন্টারন্যাশনাল স্টাডিজের চেয়ারম্যান সাজ্জাদ হোসেনের দায়ের করা একটি আত্মসাতের মামলার মামলায় শোয়েব চৌধুরীকে কারাগারে প্রেরণ করে। ২০১৫ সালে তিনি মুখ্য মহানগর হাকিম আদালত (বাংলাদেশ) দোষী সাব্যস্ত হন এবং চার বছরের সশ্রম কারাদণ্ডে দণ্ডিত হন। 

গ্রেফতার
"সাপ্তাহিক ব্লিটজ"
ইনকিলাব টেলিভিশন
বিতর্ক