দুর্গটির আরও বৈশিষ্ট্য হল এই যে বাইরের প্রাকারে ঘেরা সমগ্র অংশটির মধ্যে অনেকগুলি স্তর বা প্ল্যাটফর্ম আবিষ্কৃত হয়েছে। এইসব স্তরগুলিতে মোট ৫৫০টি নির্মাণের অবশেষ আবিষ্কৃত হয়েছে।
মাত্র ৫টি বাদে (যেগুলি কিছুটা চৌকোনা) এগুলির সবগুলিই গোলাকৃতি। এদের মধ্যে ৩০০ থেকে ৪০০টি পৃথক পৃথক বাড়ি বলে ধারণা করা হয়ে থাকে। বাড়িগুলি ছিল গোলাকৃতি, যাদের শুধুমাত্র ভিতটুকুই এখন অবশিষ্ট আছে। কিছু কিছু ক্ষেত্রে কিছু দেওয়ালের অংশও এখনও পর্যন্ত টিকে আছে; এগুলি প্রায় ৫০ সেন্টিমিটার পুরু ও কখনও কখনও এমনকী ২ মিটার পর্যন্ত উঁচু; এই অংশগুলি বেশিরভাগই খোদাই'এর কাজ দ্বারা অলংকৃত। চাচাপোয়াদের সংস্কৃতি ও বাড়ি তৈরির নিয়মকানুন সম্পর্কে এখনও পর্যন্ত যতটুকু জানা গেছে তার উপর ভিত্তি করে ধারণা করা হয়, এর নিচের স্তরে নির্মিত বাড়িগুলি ছিল সাধারণ মানুষের জন্য নির্দিষ্ট, অন্যদিকে উপরের স্তরের বাড়িগুলির বাসিন্দারা ছিল সম্ভবত মূলত অভিজাত শ্রেণির মানুষ। এই উপরের স্তরটি দুর্গের উত্তরপশ্চিম অংশে অবস্থিত ছিল ও সমগ্র অংশটি একটি ১১.৫ মিটার উঁচু দেওয়াল দিয়ে ঘেরা ছিল। এর ভেতরে প্রবেশের জন্য মাত্র দু'টি সঙ্কীর্ণ প্রবেশপথ দেখতে পাওয়া গেছে। এর থেকে ধারণা করা হয় যে এই "পুয়েব্লো আলতো" (স্পেনীয় - "Pueblo alto" অর্থাৎ উঁচু বসতি) বা উপরের স্তরের বাসিন্দারা ছিল সামরিক বাহিনীর সদস্য। নিচের স্তরের বাড়িগুলি ছিল তুলনায় সাধারণ। বাড়িগুলিতে প্রায়শই মাটির নিচেও একটি করে কুঠুরি ছিল। তবে বাড়িগুলির যেটুকু অবশেষ আবিষ্কৃত হয়েছে, তাতে সেগুলির আভ্যন্তরীন পরিকল্পনা, অর্থাৎ খাবার ঘর, শোবার ঘর বা রান্না করার স্থান কীরকম ছিল - সে' সম্বন্ধে আমাদের ধারণা এখনও পর্যন্ত খুব স্পষ্ট নয়। দুর্গের একেবারে মধ্যবর্তী অঞ্চলে "পুয়েব্লো আলতোর" মধ্যে একটি চৌকোনা বাড়ির অস্তিত্ব খুঁজে পাওয়া গেছে, যার নির্মাণশৈলী কিছুটা ইনকাদের মতো, চাচাপোয়াদের সাধারণ নির্মাণশৈলীর মতো চোঙাকৃতি নয়। ধারণা করা হয় এটি ছিল সমাজের সর্বোচ্চস্তরের নেতার জন্য নির্দিষ্ট। এর কাছাকাছিই আরও তিনটি বাড়ির ধ্বংসাবশেষ খুঁজে পাওয়া গেছে; এগুলিও চৌকোনা ও আয়তাকার। এই বিশেষ বাড়িগুলি অপেক্ষাকৃত পরবর্তী যুগের, সম্ভবত এই অঞ্চলে ইনকাদের আধিপত্যের সমসাময়িক। বিশেষত এগুলি খনন করে এর তলে আরও পুরনো কিছু বসতির চিহ্ন খুঁজে পাওয়া যাওয়ায় ঐতিহাসিকদের এই ধারণা আরও দৃঢ় হয়।

প্রবেশপথ
এল তিনতেরো
নজরদারি স্তম্ভ
দুর্গের অভ্যন্তর