মেজর ফারুক, মেজর সুলতান শাহরিয়ার রশিদ খান এবং প্রাক্তন প্রতিমন্ত্রী তাহেরউদ্দিন ঠাকুরকে ১৯৯৬ সালের ১৪ আগস্ট গ্রেপ্তার করা হয়েছিল, একই বছর বাংলাদেশ আওয়ামী লীগ ক্ষমতায় আসে। রাষ্ট্রপতি শেখ মুজিবের ব্যক্তিগত সহকারী এএফএম মহিতুল ইসলাম বিদ্রোহীদের বিরুদ্ধে ধানমন্ডি থানায় ২ অক্টোবর ১৯৯৬ সালে একটি মামলা দায়ের করেছিলেন। অপরাধ তদন্ত বিভাগ পরদিন মামলাটি তদন্ত শুরু করে। সিআইডি ১৯৯ 1997 সালের ১৫ জানুয়ারী ২০ জনের বিরুদ্ধে অভিযোগ চাপায়। 

১৯৯৭ সালের ১২ মার্চ কারাগারে থাকা ৬ বন্দি ও দেশের বাইরে থাকা ১৪ জনকে নিয়ে বিচার শুরু হয়েছিল। খন্দকার আবদুর রশিদের স্ত্রী জোবাইদা রশিদ অভিযোগপত্র থেকে অব্যাহতি পেয়েছিলেন, তিনি অভিযোগ গঠনের পরে অভিযুক্তকে কমিয়ে ১৯-এ নামিয়েছিলেন। হাইকোর্টে দায়ের করা অন্যান্য মামলাগুলি ট্রায়াল আদালতের বৈধতা এবং এর অবস্থান, ক্ষতিপূরণ আইনের দণ্ডকে চ্যালেঞ্জ জানিয়েছে, যা বিচারকে বিলম্ব করেছিল। মেজর হুদা ১৯৯৮ সালে থাইল্যান্ড থেকে বাংলাদেশ ও থাইল্যান্ডের মধ্যে প্রত্যর্পণ চুক্তির স্বাক্ষরের মাধ্যমে আনা হয়েছিল। ঢাকা জেলা জজ কোর্টের বিচারপতি কাজী গোলাম রসুল ১৯৮৮ সালের ৮ নভেম্বর ১৯৯৮ সালে ১৫ জন আসামিকে মৃত্যুদণ্ডের রায় দেন। বাংলাদেশ হাইকোর্টে আপিল করা হয়েছিল। ১৯৯৮ সালের ১৪ নভেম্বর হাই কোর্ট বিচারপতি মো. রুহুল আমিনের সাথে বিভক্ত রায় প্রদান করে দোষীদের মধ্যে ১০ জনের মৃত্যুদণ্ড বহাল রাখেন, বিচারপতি এবিএম খায়রুল হক সকল ১৫ জনের মৃত্যুদণ্ড বহাল রেখেছেন। মামলাটি তৃতীয় বিচারপতি মোহাম্মদ ফজলুল করিমকে প্রেরণ করা হয়েছিল, যিনি অভিযুক্তদের ১২ জনকে সাজা দিয়ে মৃত্যুদণ্ড কার্যকর করার রায় প্রদান করেন। 

এরপরে প্রধান বিচারপতি রুহুল আমিন ৫ জন বিচারপতি সমন্বয়ে আপিল আদালত গঠন করেন, তারা হলেন বিচারপতি সুরেন্দ্র কুমার সিনহা, বিচারপতি মোঃ আবদুল আজিজ, বিচারপতি মোঃ তাফাজুল ইসলাম, বিচারপতি বি কে দাস, এবং বিচারপতি মোঃ মোজাম্মেল হোসেন । ১৯৯৯ সালের ১৯ নভেম্বর আপিল বিভাগের রায় ১২ দণ্ডপ্রাপ্ত ব্যক্তির মৃত্যুদণ্ডের বিষয়টি নিশ্চিত করে। যার মধ্যে তিন জন রাষ্ট্রপতি ক্ষমা চেয়েছিলেন কিন্তু তাদের প্রত্যাখ্যান করা হয়েছিল। ২৭ জানুয়ারি ২০১০-তে, বাংলাদেশ সুপ্রিম কোর্ট দণ্ডপ্রাপ্তদের পুনর্বিবেচনার আবেদন প্রত্যাখ্যান করেছিল। ২৮ শে জানুয়ারী, ২০১০, হেফাজতে দোষীদের মধ্যে পাঁচজনকে ফাঁসি কার্যকর করা হয়েছিল। ফাঁসির দণ্ডপ্রাপ্তরা হলেন সুলতান শাহরিয়ার রশিদ খান, একেএম মহিউদ্দিন আহমেদ, মহিউদ্দিন আহমেদ, সৈয়দ ফারুক রহমান, এবং বজলুল হুদা । 

ভবিষ্যৎ ফল
বঙ্গবন্ধু ভবন
বিচার
বাংলাদেশ বেতার