নক্স ফ্রান্সের ডাইপ্পে ডুবে গিয়ে জেনেভাতে চলে যান, যেখানে জন ক্যালভিন তার কর্তৃত্ব প্রতিষ্ঠা করেছিলেন। নক্স এসে পৌঁছলে কেলভিন একটি কঠিন অবস্থানে ছিলেন। সম্প্রতি তিনি বৈধর্ম্য জন্য পণ্ডিত মাইকেল স্যারভেটাস মৃত্যুদন্ড কার্যকর করেছিলেন। নক্সকে চারটি কঠিন রাজনৈতিক প্রশ্ন জিজ্ঞাসা করলেন: একজন নাবিক ঐশ্বরিক অধিকার দ্বারা শাসন করতে পারেন কিনা, কোন মহিলা শাসন করতে পারে এবং তার স্বামীর কাছে সার্বভৌমত্ব হস্তান্তর করতে পারে কিনা, মানুষকে অহংকারী বা মূর্তিপূজা শাসকদের মেনে চলতে হবে কিনা এবং কোন ধর্মীয় ব্যক্তিকে অনুসরণ করা উচিত যদি তারা কোন মূর্তির বিরোধিতা করে শাসক। ক্যালভিন সাবধানে জবাব দিলেন এবং তাকে জুরিখে সুইস সংস্কারক হেনরিচ বুলিংগারের কাছে ডেকেছিলেন। বুলিংয়ের প্রতিক্রিয়াগুলি একইভাবে সতর্ক ছিল; কিন্তু নক্স ইতিমধ্যে তার মন তৈরি করা হয়েছে। ১৫৫৪ সালের ২০ জুলাই, তিনি মেরি টুডর এবং বিশোকে সিংহাসনে নিয়ে আসা একটি প্যামফ্লেট প্রকাশ করেছিলেন। তিনি পবিত্র রোমান সম্রাট চার্লস ভিকেও আক্রমণ করেছিলেন, তাকে "নিরো চেয়ে খ্রীষ্টের চেয়ে কম শত্রু" বলে অভিহিত করেছিলেন।

১৫৫৪ সালের ২৪ সেপ্টেম্বর একটি চিঠিতে, নক্সকে ফ্রাঙ্কফুর্টের ইংরেজি নির্বাসনের একটি মণ্ডলী থেকে তাদের মন্ত্রীদের একজন হওয়ার আমন্ত্রণ জানানো হয়েছিল। তিনি ক্যালভিনের আশীর্বাদ নিয়ে কল গ্রহণ করেছিলেন। কিন্তু তিনি যত তাড়াতাড়ি তিনি একটি দ্বন্দ্ব নিজেকে খুঁজে পৌঁছেছেন ছিল। ফ্রাঙ্কফুর্টে পৌঁছানোর উদ্বাস্তুদের প্রথম সেট একটি সংস্কারিত ধর্মপ্রচারের সাবস্ক্রাইব করেছিল এবং বুক অফ কমন প্রাইমারের একটি সংশোধিত সংস্করণ ব্যবহার করেছিল। আরো সম্প্রতি শরণার্থী পৌঁছেছেন, তবে, ক্যানটারবেরির ভবিষ্যত আর্চবিশপ এডমন্ড গ্রিন্ডাল সহ বইয়ের কঠোর প্রয়োগকে সমর্থন করেছিলেন। নক্স এবং সহকারী সহকর্মী উইলিয়াম হুইটিংহ্যাম পরামর্শের জন্য কেলভিনকে লিখেছিলেন, তারা তর্ক থেকে বিরত থাকার কথা বলেছিলেন। তাই দুই পক্ষের মধ্যে একটি আপোসের ভিত্তিতে নক্স পরিষেবার একটি অস্থায়ী আদেশে সম্মত হন। উদ্বাস্তুদের একটি নতুন ব্যাচ এসেছে যেখানে রিচার্ড কক্স, সাধারণ প্রার্থনা বইয়ের মূল লেখকগুলির মধ্যে একটি ছিল, এই সূক্ষ্ম ভারসাম্যটি হতাশ হয়েছিল। কক্স নক্সের প্যামফ্লেটকে ফ্রাঙ্কফুর্ট কর্তৃপক্ষের মনোযোগের জন্য সম্রাটকে আক্রমণ করে, যিনি নক্স ছেড়ে চলে যাওয়ার পরামর্শ দেন। ১৫৫৫ সালের ২৬ শে মার্চ ফ্রাঙ্কফুর্ট থেকে তাঁর প্রস্থান ইংল্যান্ডের চার্চের সাথে তার চূড়ান্ত লঙ্ঘন করে।

জেনেভায় ফিরে আসার পর, নেলকে ক্যালভিনের কাছ থেকে গৃহীত উপাসনার নতুন স্থানে মন্ত্রীর পদে মনোনীত করা হয়। ইতিমধ্যে, এলিজাবেথ বোয়েস নক্সকে লিখেছিলেন, তাকে স্কটল্যান্ডের মার্গারিতে ফিরে যাওয়ার অনুরোধ জানিয়েছিলেন, যা তিনি আগস্টের শেষে করেছিলেন।স্কটল্যান্ডের সংস্কারের অবস্থা সম্পর্কে প্রাথমিক সন্দেহ থাকা সত্ত্বেও, নক্সকে ১৫৪৭ সালে গ্যালীতে বহিষ্কৃত হওয়ার পর থেকে দেশটি উল্লেখযোগ্যভাবে পরিবর্তিত হয়েছিল। স্কটল্যান্ডের বিভিন্ন অংশে সংস্কারিত মতবাদ ও ধর্মপ্রচার প্রচারের সময় তিনি বেশিরভাগের দ্বারা স্বাগত জানালেন। স্কটল্যান্ডের দুই ভবিষ্যত শাসক, আর্ল অফ মোরে এবং আর্ল অফ মার সহ সহজাততা।

যদিও রানী রিজেন্ট, মাইস অফ গুয়েস, নক্সের বিরুদ্ধে কোন পদক্ষেপ নেননি, তার ক্রিয়াকলাপ চার্চ কর্তৃপক্ষের মধ্যে উদ্বেগ সৃষ্টি করেছিল। স্কটল্যান্ডের বাইশরা তাকে তাদের কর্তৃপক্ষের হুমকি বলে মনে করে এবং ১৫ মে ১৫৫৬ সালে তাকে ১৫ ই সেপ্টেম্বর এডিনবার্গে উপস্থিত হওয়ার আহ্বান জানায়। তিনি এত প্রভাবশালী ব্যক্তিদের দ্বারা বিচারের সম্মুখীন হন যে বিশপস শুনানি বন্ধ করার সিদ্ধান্ত নেয়। নক্স এখন এডিনবার্গে খোলাখুলি প্রচার করার জন্য উন্মুক্ত ছিল। আর্ল মারিশালালের উইলিয়াম কিথ চমকে উঠেছিলেন এবং নক্সকে রানী রিজেন্টকে লিখতে অনুরোধ করেছিলেন। নক্সের অসাধারণ শ্রদ্ধাশীল চিঠিটি তাকে সংস্কারের সমর্থনে এবং গির্জার আধিপত্যকে উৎখাত করার আহবান জানান। রানী মেরি চিঠিটি মজাদার হিসাবে গ্রহণ করেছিলেন এবং এটিকে উপেক্ষা করেছিলেন।

ফরাসি গলি(১৫৪৭-১৫৪৯)
নক্স এবং রানী মেরি(১৫৬১-১৫৬৪)
জেনেভা ফেরা (১৫৫৬-১৫৫৯)
জেনেভা থেকে ফ্রাঙ্কফুর্ট এবং স্কটল্যান্ড (১৫৫৪-১৫৫৬)