অপব্যবহার, গ্রেপ্তার, পুনর্বাসন এবং পিছুটানে ভরা পাঁচ বছর পেরিয়ে ডাউনি তার হারানো জীবন ফিরে পেল যা কিনা আজ পুরোপুরি মাদকমুক্ত। ডাউনি তার অতীতের মাদকমুক্ত হবার ব্যর্থ প্রচেষ্টার কথা অপরাহ উইনফ্রেকে ২০০৪ এ বর্ণনা করছিল এভাবে, “যখন কেউ বলত, আমিও সত্যিই ভাবতাম আমার পুনর্বাসনে যাওয়া উচিত? ওহ, খোদা, তুমি নিজেকে ধ্বংস করছ, তুমি তোমার চাকরি হারিয়েছ, এবং তোমার স্ত্রী তোমাকে ত্যাগ করেছে। ওফ, তোমার অন্তত একটা চেষ্টা করা উচিত।” তিনি আরও বলেন যে ২০০১ সালের এপ্রিলে তার শেষ গ্রেপ্তারের পর, যখন তিনি বুঝতে পারলেন তাকে আবারও কয়েদি জীবনের মুখোমুখে হতে হবে অথবা আদালতের আদেশে মাদকপুনর্বাসন কেন্দ্রে পাঠানো হতে পারে, যা জেলের থেকে কম নয়, “আমি বললাম, তুমি কি জানো? এই কাজ আমি চালিয়ে যেতে পারব বলে মনে করিনা, আমি সাহায্য ভিক্ষা করছি এবং সেই পথেই চলতে চাই। তুমি এমন অগোছালো ভাবেও সাহায্য প্রার্থনা করলে সাহায্য পাবে, কিন্তু তুমি সেটা থেকে উপকৃত হতে পারবে না। এর থেকে পরিত্রাণ আপাতদৃষ্টিতে যতটা ভয়ানক সমস্যা মনে করছ ততটা নয় ... প্রকৃতপক্ষে কঠিন কাজ হল মনস্থির করা, আসলেই তুমি এটা করতে চাচ্ছ।”

২০০১ এর আগস্টে ডাউনি পুনর্বাসনে থাকাকালীন সময়ে প্রথম অভিনয় কাজ পেয়েছিলেন এলটন জনের একক গান “আই ওয়ান্ট লাভ” ভিডিওতে, তার কাজ ছিল গানের সঙ্গে ঠোট মিলানো। চিত্র পরিচালক স্যাম টেইলর উড ভিডিওটি ১৬ বারে ধারন করেন এবং শেষেরটাকে চুড়ান্ত হিসাবে গ্রহণ করেন। জনের ভাষ্যমতে, ডাউনিকে সম্পূর্ণ ভারমুক্ত দেখা যাচ্ছিল, এবং “এত সহজভাবে বিষয়টি তুলে ধরেছে যা ছিল অসাধারন।”

এয়ার আ্মেরিকাতে সহশিল্পী হিসেবে কাজের সূত্রে মেল গিবসনের সাথে পরিচয় হয়েছিল ডাউনির যা পরর্বতীতে অন্তরঙ্গ বন্ধুত্বে রুপ নেয় এবং শুধুমাত্র এই মেল গিবসনের কল্যাণেই ডাউনি বড়পর্দায় ফিরে আসতে সক্ষম হন, কারণ ২০০৩ সালে কিথ গর্ডন পরিচালিত "দ্য সিংগিং ডিটেকটিভ" চলচ্চিত্রে ডাউনির নিরাপত্তা বিমা পরিশোধ করে দেয় গিবসন। গিভসনের এই চরম বাজিই ডাউনির নিজেকে ফেরার পথের সোপান হয়ে দাড়াল। ২০০০ এর মধ্যভাগে চিত্রায়িত ভৌতিক চলচ্চিত্র "গোথিকা" দিয়ে তিনি চলে আসেন সামনের সারিতে এবং ডাউনির মাদকাসক্তি জন্যে এই চলচিত্রে প্রযোজক জোয়েল সিলভার ডাউনির মূল পারিশ্রমিকের ৪০ শতাংশ আটকে রাখেন শুটিং ঝামেলামুক্ত শেষ হবার আগপর্যন্ত। পরবর্তীতে এই শর্তখানা ডাউনির জন্যে স্বাভাবিক নিয়মের মধ্যে জারি হয়ে যায়।

২০০৩ সালে "গোথিকার" সাফল্যের পর ডাউনি অনেক চলচিত্রে মূল ও পাশ্বচরিত্রে অভিনয় করেন, তন্মধ্যে উল্লেখযোগ্য সাফল্য পায় "আ গাইড টু রেকগনাজিং ইয়র সেন্ট", "গুড নাইট এন্ড গুড লাক", রিচার্ড লিংকলেটারের রূপক রটোস্কোপ্ট "আ স্ক্যানার ডার্কলি" (যেখানে ডাউনি একজন মাদকাসক্তের চরিত্রে অভিনয় করেন) এবং স্টিফেন সেইনবার্গ এর ডিয়ান আর্বাস নামে এক কাল্পনিক জীবনীসংক্রান্ত চলচ্চিত্র ফার, এখানে ডাউনির চরিত্র আরবাস এর পেশাগত জীবনে বড় প্রভাববিস্তারকারী দুইজনকে ফুটিয়ে তোলেন (লিসেট মডেল এবং মারভিন ইস্রায়েল)। ডাউনি হাস্যরসাত্মক রোমাঞ্চকর চলচিত্র "কিস কিস ব্যাং ব্যাং" এর মূলচরিত্রে অভিনয় করে যথেষ্ট সুনাম অর্জন করেন আবার কম সমাদৃত ডিজনীর "দ্য স্যাগি ডগ" ও এই তালিকায় রয়েছে।

সনি ক্লাসিক্যালের মাধ্যমে ২০০৪ এর ২৩ নভেম্বরে ডাউনি তার প্রথম একক সঙ্গিত অ্যালবাম "দ্য ফিউচারিস্ট" উন্মোচন করেন, যার প্রচ্ছদ শিল্প ও সিডির উপর শিল্পের নকশা করান তার ছেলে ইন্ডিও দ্বারা। এটি "বিলবোর্ড ২০০" তালিকার মধ্যে ১২১ তমতে আত্মপ্রকাশ পায় এবং মুক্তি লাভের প্রথম সপ্তাহেই অ্যালবামটি ১৬,০০০ কপি বিক্রিত হয়। অ্যালবামটি মিশ্র সমালোচনাও পেয়েছে, ২০০৬ এ ডউনি জানান, পূর্ণ অ্যালবাম করার মতো যথেষ্ট শক্তি তার নেই বলে মনে করেন এবং সম্ভবত তিনি আর কোন অ্যালবাম করবেননা।

২০০৬ সালে ডউনি টেলিভিশনের পর্দায় ‍ফিরে আসেন “ফ্যামিলি গাই” এর অতিথি চরিত্র “দ্য ফ্যাট গাই ষ্ট্যাগলার” পর্বের মাধ্যমে। অনুষ্ঠানটির প্রযোজকের কাছে ডউনি ফোনের মাধ্যম অনুরোধ করেন যে, তিনি কোনো পর্ব প্রযোজনা কিংবা সহায়তা করতে পারেন কিনা, যেহেতু তার ছেলে ইন্ডিও অনুষ্ঠানটির খুব ভক্ত। প্রযোজকগণ প্রস্তাব গ্রহণ করেন এবং ডউনির জন্যে লুইস গ্রিফিন এর দীর্ঘদিনের হারিয়ে যাওয়া ভাই প্যাট্টিক পিউটার্সমিড চরিত্র তৈরি করেন, যে মানসিকভাবে দুর্বল। সে বছরই ডউনি প্রকাশক হার্পার কলিন্সের কাছে চুক্তিবদ্ধ হয়েছিলেন তার আত্ম-জীবনী লেখা প্রকাশের জন্যে এবং ২০০৬ সালে তার কর্মজীবনের উত্থান পতনের অকপট বর্ণনা লেখার জন্যে অগ্রিম পারিশ্রমিক গ্রহণ করেছিলেন। অবশ্য ২০০৮ সালে ডউনি প্রকাশককে সকল অগ্রিম পারিশ্রমিক ফিরিয়ে দেয় কোন প্রকার পরবর্তী নিশ্চয়তা ছাড়া।

২০০৭ সালে মুক্তিপ্রাপ্ত রহস্য চলচ্চিত্র "জোডিয়াক"-এ অভিনয় করেন ডাউনি। ১৯৬৯ সালে উত্তর ক্যালিফোর্নিয়ার এক ক্রমিক খুনির সত্য ঘটনাকে ভিত্তি করে ছবিটির কাহিনী গড়ে উঠেছে। এখানে ডাউনি পল এ্যভারি নামের একজন "স্যান ফ্রানসিকো ক্রোনিক্যাল" এর সংবাদিক রূপে অভিনয় করেন, যিনি ক্রমিক খুনি জুদিয়াক ঘটনার প্রতিবেদনের দায়িত্বরত ছিলেন। কাহিনীতে দেখা যায়, প্রত্যেক হত্যার পর খুনি স্থানীয় পুলিশ ও সংবাদসংস্থাকে জানিয়ে একটি চিঠি দিতেন যাতে তিনি তার নাম জুদিয়াক বলে উল্লেখ করেন এবং এসব চিঠিগুলোতে সাংকেতিক ভাষা ব্যবহার করা হত। ছবিটির কাহিনী নেওয়া হয় লেখক রবার্ট গ্রেস্মিথের রচিত একই নামের অ-কথাসাহিত্য বই থেকে। ছবির পরিচালক ডেভিড ফিঞ্চার সমালোচকদের দৃষ্টিতে প্রশংসিত হন, এবং চলচ্চিত্রটি বেশ কয়েকটি পুরস্কারের জন্য মনোনীত হয়। ছবিটিতে ডাউনির অভিনয় সম্পর্কে "দ্য গার্ডিয়ান"-এর মত: আমরা ডাউনিকে চলচ্চিত্রের শ্রেষ্ঠ সাংবাদিক হিসেবে শীর্ষ দশে রেখেছি, যদিও তিনি সাংবাদিক পল এ্যভারির ভূমিকায় অদ্ভুত অভিনয় করেছেন।

২০০১-২০০৮: পেশাজীবনে প্রত্যাবর্তন
চলচ্চিত্র তালিকা এবং পুরস্কার
১৯৮৩–১৯৯৫: সূচনা এবং সমালোচকদের দ্বারা প্রশংসিত
পুরস্কার এবং মনোনয়ন