২২ শে নভেম্বর, ২০০৭ সালে তত্কালীন রাষ্ট্রপতি আবদুল্লাহি ইউসুফ আহমেদ ২৯ শে অক্টোবর আলী মোহাম্মদ ঘেদী এর পূর্বের পদত্যাগের পরে হুসেনকে স্থানান্তরীয় ফেডারাল সরকারের প্রধানমন্ত্রী মনোনীত করেছিলেন। সেলিম আলিয়া ইব্রো গেডি ও হুসেনের সময়কালে অন্তর্বর্তীকালীন প্রধানমন্ত্রী হিসাবে দায়িত্ব পালন করেছিলেন। ২১২ ভোটের মধ্যে ২১১ ভোট পেয়ে হুসেনকে বাইদোয়ায় ট্রানজিশনাল ফেডারেল পার্লামেন্ট কর্তৃক ২৪ নভেম্বর অনুমোদিত হয়েছিল এবং এর পরপরই তিনি শপথ গ্রহণ করেছিলেন। হুসেনের সরকার, যাকে তিনি "সর্ব-অন্তর্ভুক্ত" হিসাবে বর্ণনা করেছিলেন, ২ ডিসেম্বর, ৭৩ জন সদস্যের সাথে নিযুক্ত হন; সরকারের অন্তর্ভুক্ত ছিলেন ৩১ জন মন্ত্রী, ১১ জন প্রতিমন্ত্রী এবং ৩১ জন সহকারী মন্ত্রী। সোমালি সরকার ব্যতিক্রমী আকারের জন্য হুসেন কিছু সমালোচনা পেয়েছিলেন; হুসেনের মতে, সরকারের নামকরণে তিনি ২০০৪-এর ট্রানজিশনাল ফেডারেল চার্টার দ্বারা প্রয়োজনীয় "৪.৪" সূত্র বা কোটা অনুসরণ করেছিলেন, যা মূলত চারটি গোষ্ঠী এবং ছোট গোষ্ঠীর একটি গ্রুপের মধ্যে পোস্ট বিভক্ত করার ব্যবস্থা করে। হাসান মুহাম্মদ নূর শতিগাদুদ (যাকে স্বরাষ্ট্র নিরাপত্তা মন্ত্রীর পদে নিয়োগ দেওয়া হয়েছিল), আবদিকাফি হাসান, শেখ আডেন মাদেন এবং ইব্রাহিম মোহাম্মদ ইসহাক মন্ত্রীর মধ্যে চারজনই ডিসেম্বরে ৩ ডিসেম্বর পদত্যাগ করেছিলেন, অভিযোগ করেছেন যে তাদের বংশ, রাহানউইন (চারটি প্রধান গোষ্ঠীর মধ্যে একটি) সরকারে অপ্রতুলভাবে প্রতিনিধিত্ব করেছিল এবং তাদের নিয়োগের বিষয়ে তাদের আগে পরামর্শ নেওয়া হয়নি। ৪ ডিসেম্বর, ধর্ম বিষয়ক উপমন্ত্রী শেখ জামা হাজী হুসেনও তার বংশ, জেরারউইন, যা একটি ছোট বংশের মধ্যে একটি, তার জন্য সরকারে পদে অন্যায়ভাবে বরাদ্দের অভিযোগ করে পদত্যাগ করেছিলেন। 

১৭ ডিসেম্বর হুসেইন বলেছিলেন যে তিনি তার পূর্বের নিযুক্ত সরকারের চেয়েও "আরও ছোট, আরও কার্যকর প্রশাসন" দিয়ে মন্ত্রীপরিষদ গঠন করছেন। এই নতুন সরকারকে মাত্র ১৭ জন মন্ত্রী এবং পাঁচ জন উপমন্ত্রীকে অন্তর্ভুক্ত করার পরিকল্পনা করা হয়েছিল, এবং সংসদের বাইরের লোকদেরও অন্তর্ভুক্ত করার কথা ছিল। 

হুসেইন নিযুক্ত ১৫ মন্ত্রীরা ৪ জানুয়ারি২০০৮ এ এবং পাঁচ সহায়ক মন্ত্রীরা ৫ জানুয়ারি শপথ গ্রহণ করে। তিনজন অতিরিক্ত মন্ত্রীর নাম পদবী অনুসারে রাখা বাকি ছিল। সংসদ ১০ জানুয়ারিতে নতুন মন্ত্রিসভাকে অনুমোদন দিয়েছে, ২২৩ ভোটের পক্ষে, পাঁচটি বিরোধী এবং দুটি এড়িয়ে যায়। 

শান্তিরক্ষী এবং দাফতরিক সমস্যা
প্রধানমন্ত্রী
প্রাথমিক জীবন
মৃত্যু