એનટીએફએસ (NTFS)માં તમામ ફાઇલ ડેટા ફાઇલ નેઇમ, ક્રિયેશન તારીખ, એક્સેસ પરમિશન્સ અને સૂચિને માસ્ટર ફાઇલ ટેબલમાં મેટાડેટા તરીકે સંગ્રહ કરવામાં આવે છે. આ વિશિષ્ટ પ્રક્રિયા વિન્ટોઝ એનટીના વિકાસ દરમિયાન ફાઇલ સિસ્ટમના સરળ ઉમેરાની મંજૂરી આપે છે-તેનું રસપ્રદ ઉદાહરણ એ છે એક્ટીવ ડિરેક્ટરી સોફ્ટવેર દ્વારા ઉપયોગમાં લેવાતા ઇન્ડેક્સીંગ ફિલ્ડનો ઉમેરો. એનટીએફએસ (NTFS) નામ એનકોડીંગ માટે 16 બીટ વાળી કોઇ પણ શ્રેણી પૂરી પાડે છે (ફાઇલ નામ, સ્ટ્રીમ નામ, ઇન્ડેક્સ નામ વગેરે).તેનો અર્થ એ કે યુટીએફ-16 કોડપોઇન્ટસને ટેકો પ્રાપ્ત થયો છે, પરંતુ ફાઇલ સિસ્ટમ યુટીએફ-16 માન્ય છે કે કેમ તેની ચકાસણી કરતું નથી. (તે ઓછા મૂલ્યવાળી કોઇ પણ શ્રેણીની સવલત પૂરી પાડે છે, પરંતુ યુનિકોડ સ્ટાન્ડર્ડમાં મર્યાદિત નથી).

આંતરિક રીતે, એનટીએફએસ (NTFS) ફાઇલ સિસ્ટમ ડેટાને ઇન્ડેક્સ કરવા માટે બી+ ટ્રી નો ઉપયોગ કરે છે. અમલ કરવા માટે મુશ્કેલ હોવા છતા, તે મોટા ભાગના કેસમાં ઝડપી સમય લૂક અપ સમય પૂરો પાડે છે. ફાઇલ સિસ્ટમ જર્નલ નો ઉપયોગ ફાઇલ સિસ્ટમ મેટાડેટાની વિશ્વસનીયતાની બાંયધરી માટે થાય છે, વ્યક્તિગત ફાઇલ્સ સૂચિ માટે નહી. એનટીએફએસ (NTFS)નો વપરાશ કરતી સિસ્ટમ્સ ફેટ ફાઇલ સિસ્ટમમાં સુધારેલી વિશ્વસનીયતા ધરાવવા માટે જાણીતી છે. 

માસ્ટર ફાઇલ ટેબલ (એમએફટી (MFT))માં મેટાડેટા નો સમાવેશ થાય છે, જેમાં એનટીએફએસ (NTFS) વોલ્યુમ પર દરેક ફાઇલ, ડિરેક્ટરી અને મેટાફાઇલનો સમાવેશ થાય છે. તેમાં ફાઇલનેઇમ્, સ્થળો, કદ અને મંજૂરીઓનો સમાવેશ થાય છે. તેનું માળખું એલ્ગોરિધમને ટેકો પૂરો પાડે છે, જે ડિસ્ક ફ્રેગમેન્ટેશન ને ઓછામાં ઓછું કરે છે. ડિરેક્ટરી એન્ટ્રીમાં ફાઇલનેઇમ્સ અને "ફાઇલ આઇડી"નો સમાવેશ થાય છે, જે માસ્ટર ફાઇલ ટેબલમાં સૌથી વધુ ક્રમાંકો પ્રદર્શિત કરતી ફાઇલ છે. ફાઇલ આઇડી પણ ચોરાઇ ગયેલા સંદર્ભોને શધી કાઢવા માટે રેસ્ક્યુ કાઉન્ટ ધરાવે છે. આ બાબત જ્યારે Files-11 ના W_FID સાથે મજબૂત રીતે મળતી આવે છે, ત્યારે અન્ય એનટીએફએસ (NTFS) માળખું ધરમૂળથી અલગ છે. 

ગુણધર્મો
એન્ક્રાઇપ્ટીંગ ફાઇલ સિસ્ટમ (ઇએફએસ)
ઇન્ટરનલ્સ (આંતરિક ભાગો)
વૈકલ્પિક(ઓલ્ટરનેટ) ડેટા સ્ટ્રીમ્સ(એડીએસ)