વધુ જટિલ ગાણિતીક નિયમોનાં નિર્માણ માટે એક કે તેથી વધુ સંકેતલિપીનાં પૌરાણિક સાધનોનો ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો છે. જેને સંકેતલિપીની પદ્ધતિઓ અથવા તો "સંકેતલિપી વિષયક પદ્ધતિઓ" કહેવામાં આવે છે. કેટલીક સંકેતલિપી વિષયક પદ્ધતિઓ (જેમ કે એલ-ગેમેલ એન્ક્રિપ્શન)ને કોઇ એક વસ્તુનું સંચાલન કરવા (જેમ કે સાર્વજનિક ચાવીનું એન્ક્રિપ્શન કે સંદેશાનું નિર્માણ) માટે બનાવવામાં આવી છે. જ્યારે કેટલાક સલામતીના ગુણધર્મો પણ તેમાં છે. (જેમ કે રેન્ડમ ઓરેકલ મોડલમાં રહેલી સીપીએ સિક્યુરિટી) પદ્ધતિમાં રહેલા સુરક્ષાના ગુણધર્મોને ટેકો આપવા માટે સંકેતલિપી વિષયક પદ્ધતિઓમાં પૌરાણિક સંકેતલિપીનાં ગુણધર્મોનો ઉપયોગ કરવામાં આવે છે. નિશંકપણે સંકેતલિપી વિષયક પદ્ધતિઓ અને પૌરાણિક સંકેતલિપી વચ્ચેના ભેદ મુનસફી મુજબના હોવાને કારણે વ્યવહાર કુશળ સંકેતલિપીઓ કેટલીક પૌરાણિક સંકેતલિપીઓ ઉપરથી ઉતરી આવી હોઇ શકે છે. ઘણા કિસ્સાઓમાં સંકેતલિપીનાં માળખાંમાં જૂનાં અને ાગામી સંચારને સમાવવામાં આવે છે. અને તેમાં બે કરતાં વધારે પક્ષકારો હોય છે. (દા.ત. સલામત સંદેશો મેળવનાર અને મોકલનાર) જ્યારે નવા યુગમાં (દા. ત. સંકેતલિપી દ્વારા સુરક્ષિત બેકઅપ ડેટા) સંકેતલિપીની આ પ્રકારની પ્રક્રિયાને ઘણી વખત "સંકેતલિપીના સિદ્ધાંતો" તરીકે ઓળખવામાં આવે છે.

કેટલીક પ્રચલિત સંકેતલિપીની પદ્ધતિઓમાં આરએસએ એન્ક્રિપ્શન, શ્નોર સિગ્નેચર, એલ-ગેમેલ એન્ક્રિપ્શન, પીજીપી વગેરેનો સમાવેશ થાય છે. વધુ જટિલ સંકેતલિપીની પ્રક્રિયામાં ઇલેક્ટ્રોનિક કેશ સિસ્ટમ્સ, સિગ્નરિપ્શન સિસ્ટમ વગેરેનો સમાવેશ થાય છે. કેટલીક વધુ સૈદ્ધાંતિક સંકેતલિપીમાં ઇન્ટરએક્ટિવ પ્રૂફ સિસ્ટમ (જેવી કે ગુપ્તતાની વહેંચણી માટેની ઝિરો નોલેજ પ્રૂફ સિસ્ટમ.) વગેરે.

હમણાના સમયગાળા સુધી મોટા ભાગનાં સુરક્ષાના ગુણધર્મો એવી સંકેતલિપીના ગુણધર્મો ઉપયોગમાં લેતા હતા કે જેમાં પ્રયોગમૂલક તકનીકો અથવા તો હંગામી તાર્કીકતાનો ઉપયોગ કરવામાં આવતો હતો. તાજેતરમાં સંકેતલિપી ક્ષેત્રે સુરક્ષાનો વધારો થાય તેવી ઔપચારિક તકનીકો શોધવા માટે નોંધપાત્ર પ્રયાસો કરવામાં આવ્યા છે. જેને સામાન્યતઃ "પ્રોવેબલ સિક્યુરિટી" કહેવામાં આવે છે. પ્રોવેબલ સિક્યોરિટીનો સમાન્ય ખ્યાલ કોઇ પણ જાતની ગાણિતીક મુશ્કેલી વિના આપવામાં આવતી દલીલ જે સંકેતલિપીની સુરક્ષાના સમાધાન માટે જરૂરી હોય છે. (જેમ કે કોઇ પણ વિરોધીને).

સોફ્ટવેર એપ્લિકેશન્સમાં સમગ્ર સંકેતલિપીનો અસરકારક અને શ્રેષ્ઠત્તમ ઉપયોગ કઇ રીતે કરી શકાય તે અંગેના અભ્યાસ માટે જુઓ ક્રિપ્ટોગ્રાફિક એન્જિનિયરિંગ અને સિક્યુરિટી એન્જિનિયરિંગ

પરિભાષા
સાર્વજનિક ગૂઢ સંકેતલિપી
પ્રાચીન સંકેતલિપી
સંકેતલિપી વિષયક પદ્ધતિઓ