मुखर्जी ने कमला गर्ल्स हाई स्कूल से अपनी माध्यामिक शिक्षा प्राप्त की और पथ भवन स्कूल से उच्च माध्यमिक शिक्षा। उन्होंने १९८७ में कम्प्यूटर साइंस और <MASK> इंजीनियरिंग कॉलेज, शिबपुर की प्रौद्योगिकी विभाग से इंजीनियरिंग की डिग्री प्राप्त की। उन्होंने १९९१ में, जादवपुर विश्वविद्यालय, कंप्यूटर विज्ञान और इंजीनियरिंग विभाग से इंजीनियरिंग डिग्री की मास्टर की उपाधि अर्जित की। मुखर्जी का पीएचडी काम समानांतर कंप्यूटिंग में था। २००१ में वह उच्च प्रदर्शन कंप्यूटिंग के शोध के लिए न्यूकैसल विश्वविद्यालय गए।
नंदीनी मुखर्जी
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