ভুট্টো তার মাধ্যমিক শিক্ষা করাচি আমেরিকান স্কুলে করেছিলেন। তিনি ২০০৪ সালে <MASK> নিউইয়র্কের কলম্বিয়া বিশ্ববিদ্যালয়ের বার্নার্ড কলেজ থেকে বিএ ডিগ্রি নিয়ে স্নাতক হন, বার্নার্ডেতে তিনি মধ্যপ্রাচ্য এবং এশীয় ভাষা ও সংস্কৃতিতে মুখ্য ছিলেন।   তিনি ২০০৫ সালে লন্ডন বিশ্ববিদ্যালয়ের এসওএএস থেকে দক্ষিণ এশিয়ান স্টাডিজে এমএ করেন। সেখানে তিনি পাকিস্তানের প্রতিরোধ আন্দোলন নিয়ে তাঁর গবেষণামূলক প্রবন্ধ লিখেছিলেন। 
ফাতিমা ভুট্টো
সিরিয়া পাকিস্তানী পরিবারের যুক্তরাষ্ট্রের