পররাষ্ট্রমন্ত্রী হিসাবে তিনি ১৯৫৪ সালের সেপ্টেম্বরে ম্যানিলা চুক্তি সম্মেলনে পাকিস্তানের প্রতিনিধিত্ব করেছিলেন। পাকিস্তানের ম্যানিলা চুক্তির পক্ষে সমর্থন বিভক্ত ছিল, পশ্চিম পাকিস্তানের আধিপত্য বিস্তারকারী সেনাবাহিনী এবং এর পক্ষে পক্ষে মুষ্টিমেয় নেতারা, যখন পশ্চিম পাকিস্তান থেকে গণপরিষদের বেশিরভাগ নির্বাচিত সদস্য এবং পূর্ব পাকিস্তানের সমস্ত বিধানসভা সদস্যরা এর বিরোধিতা করেছিলেন। জাফরুল্লাহ দক্ষিণ-পূর্ব এশিয়া চুক্তি সংস্থায় ( <MASK> ) পাকিস্তানের যোগদানের প্রতিশ্রুতি দিয়ে মণিলা চুক্তিতে স্বাক্ষর করেছেন।
মুহাম্মদ জাফরুল্লাহ খান
সিইটিও লিবিয়া সুদান হেগ