১৯৯৫ সালে দুই দেশের মধ্যকার এ দ্বিপাক্ষিক সম্পর্কে অবনতি ঘটে, যখন চেক প্রজাতন্ত্র লিয়েন চান এবং তাইওয়ানের অন্যান্য সরকারি কর্মকর্তাকে তাদের দেশে রাষ্ট্রীয় সফরে যেতে দিতে সম্মত হয়। চেক প্রজাতন্ত্র টু-চায়নাস নীতিকে সমর্থন দেয় এবং <MASK> তাইওয়ানের পুনঃপ্রবেশকে অনুমোদন দেয়। ১৯৯৬ সালে অবশ্য গণপ্রজাতন্ত্রী চীনের সাথে চেক প্রজাতন্ত্রের সম্পর্ক আবারও ভালো হয়ে ওঠে, এর কারণ চেক তাদের ওয়ান চায়না পলিসিতে ফিরে আসতে সমর্থ হয়।
চেক প্রজাতন্ত্র–চীন সম্পর্ক
চেকোস্লোভাকিয়া চেকোস্লোভাকিয়ার সাংহাইয়ে জাতিসংঘে