Historiallisesti on dokumentoitu, että Bosnian kirkko oli valtionuskonto ennen ristiretkeläisiä ja ennen fransiskaanien saapumista ja että tämä uskonto oli bosniakki-kansan uskonto (jota silloin kutsuttiin bosnjanilaisiksi). Jotkut kuitenkin pakotettiin kääntymään katolilaisuuteen ja jotkut olivat niin aivopestyjä, että he hyväksyivät katolilaisuuden. Ne, jotka säilyttivät rohkeasti uskontonsa turkkilaisten saapumiseen asti, ottivat suoraan islamin vastaan, kun taas ne katolilaiset, jotka ottivat islamin vastaan, olivat yksinkertaisesti bosnialaisia bogumilaisia, jotka olivat aiemmin kääntyneet katolilaisuuteen. Koska Bosnia oli ja on edelleen eräänlainen eristyneistö, siellä ei ollut vahvaa uskontoa ja ihmiset saattoivat vaihtaa uskontoa joka viikko. Siksi monet bosnialaiset ottivat islamin vastaan.