Protéine réceptrice de l'AMPc
# Protéine réceptrice de l'AMPc

La protéine récepteur d'AMPc (en anglais CRP ; également appelée protéine activatrice de catabolite PAC ou CAP en anglais) est une protéine régulatrice que l'on trouve chez les bactéries. La protéine CRP se lie à l'AMPc, ce qui provoque un changement de conformation qui permet à la CRP de se lier étroitement à un site d'ADN spécifique au niveau des promoteurs des gènes qu'elle $contrôle^,.$ La CRP active ensuite la transcription par le biais d'interactions directes de type protéine–protéine avec l'ARN $polymérase^,.$

Les gènes régulés par la CRP sont principalement impliqués dans le métabolisme énergétique, tel que la dégradation du galactose, du citrate ou encore le système de translocation du groupe $PEP^,.$ Chez Escherichia coli, la CRP peut réguler la transcription de plus de 100 gènes.

Le signal pour activer la CRP est la liaison avec l'AMP cyclique. La liaison de l'AMPc à la CRP conduit à une transduction de signal à longue distance à partir du domaine de liaison à l'AMPc N-terminal au domaine C-terminal de la protéine. C'est cette partie qui est responsable de l'interaction avec des séquences spécifiques au niveau de l'ADN.

Chez les promoteurs dépendants de la CRP dits de "classe I", la CRP se lie à un site de l'ADN situé en amont des promoteurs principaux et active la transcription par le biais d'interactions de type protéine–protéine entre la "région d'activation 1" de la CRP et le domaine C-terminal de la sous-unité alpha de l'ARN $polymérase^,^,.$ Chez les promoteurs dépendants de la CRP dits de "classe II", la CRP se lie à un site sur l'ADN qui chevauche l’élément -35 du promoteur et active la transcription par le biais de deux ensembles d’interactions de type protéine–protéine : (1) une interaction entre la "région d'activation 1" de la CRP et le domaine C-terminal de la sous-unité alpha de l'ARN polymérase et (2) une interaction entre la "région d'activation 2" de la CRP et le domaine N-terminal de la sous-unité alpha de l'ARN $polymérase^,.$ Chez les promoteurs dépendants de la CRP dits de "classe III", la CRP fonctionne conjointement avec une ou plusieurs protéines dites $"co-activatrices"^,.$

Chez la plupart des promoteurs dont l'activation est dépendante de la CRP, celle-ci active la transcription principalement ou exclusivement par le biais d'un mécanisme de "recrutement", dans lequel des interactions de type protéine–protéine entre la CRP et l'ARN polymérase facilitent la liaison de l'ARN polymérase au promoteur.

