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Les LABoratoires d'Excellences constituent la seconde partie du financement de la recherche en France issue du Grand Emprunt. Sur les 35 milliards, 8 milliards ont été consacrés  exclusivement à la recherche par le biais des LABEX. Cependant, ce fonds a été rapidement porté à près de 50 milliards, pour bénéficier – d’après le Ministère en charge de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche – au plus grand nombre d’équipes et de laboratoires de recherche.Les financements LABEX et IDEX ne sont pas cumulables. En cas de succès d’un candidat LABEX appartenant à un établissement bénéficiant déjà d’un IDEX, les crédits du LABEX sont imputés aux crédits de l’IDEX. Autrement dit, l’IDEX finance sur ses crédits propres le LABEX.Certains LABEX ont été constitués par des laboratoires (UMR ou EA) issus de diverses universités, sans lien territorial.