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Vie et TerrePost� par Michel le Vendredi 14/10/2011 � 00:00
Un microorganisme ancestral � l'origine des virus g�ants
virus g�ants Mimivirus Megavirus chilensis 0 commentaire
Une �quipe du laboratoire Information g�nomique et structurale (IGS) du CNRS a publi� dans PNAS le 10 octobre 2011 la d�couverte, pr�s des c�tes chiliennes, d'un cousin lointain de Mimivirus dont le g�nome est une mol�cule d'ADN de 1,259 million (Un million (1 000 000) est l'entier naturel qui suit neuf cent quatre-vingt-dix-neuf mille neuf cent quatre-vingt-dix-neuf (999 999) et qui précède un million un...) de paires de bases codant pour 1120 prot�ines. Parmi celles-ci, la pr�sence de nombreuses enzymes cl� de l'appareil de traduction renforce l'hypoth�se selon laquelle un g�nome (Le génome est l'ensemble du matériel génétique d'un individu ou d'une espèce codé dans son ADN (à l'exception de certains virus dont le génome...) cellulaire ancestral serait � l'origine de celui de ces virus (Un virus est une entité biologique qui nécessite une cellule hôte, dont il utilise les constituants pour se multiplier. Les virus existent...) g�ants.
En 2003 et 2004, les chercheurs de l'IGS participaient � la d�couverte et � l'analyse du g�nome du plus grand virus jamais d�crit, Mimivirus. Avec plus de 1 000 g�nes, le premier des virus g�ants surpassait en complexit� (La complexité est une notion utilisée en philosophie, épistémologie (par exemple par Anthony Wilden ou Edgar Morin), en physique,...) de nombreuses bact�ries. Mais les records sont faits pour �tre battus ! Le m�me laboratoire vient tout (Le tout compris comme ensemble de ce qui existe est souvent interprété comme le monde ou l'univers.) juste d'isoler un nouveau virus, baptis� Megavirus chilensis, encore plus gros et g�n�tiquement plus complexe que Mimivirus, devant la station biologique marine de Las Cruces au Chili.
Tout comme Mimivirus, Megavirus chilensis est capable d'infecter par phagocytose de nombreuses souches de l'amibe Acanthamoeba, en se faisant passer (Le genre Passer a été créé par le zoologiste français Mathurin Jacques Brisson (1723-1806) en 1760.) pour une bact�rie (Les bact�ries (Bacteria) sont des organismes vivants unicellulaires procaryotes, caract�ris�es par une absence de noyau et d'organites. La plupart des...), proie (Une proie est un organisme capturé vivant, tué puis consommé par un autre, qualifié de prédateur.) habituelle des amibes. Il pr�sente �galement une capside semblable � celle de Mimivirus, recouverte d'une couche de fibres (Une fibre est une formation �l�mentaire, v�g�tale ou animale, d'aspect filamenteux, se pr�sentant g�n�ralement sous forme de faisceaux.) qui lui donne une apparence "chevelue". En outre, Mimivirus et Megavirus chilensis poss�dent 594 g�nes en commun, ou "g�nes orthologues", pour la plupart localis�s dans la partie centrale de leur g�nome, dont les extr�mit�s sont curieusement beaucoup plus variables. Cette propri�t� d�coule probablement d'un m�canisme de r�plication similaire � celui des Poxvirus responsables de la variole (La variole ou petite vérole est une maladie infectieuse d'origine virale, très contagieuse et épidémique, due à un poxvirus. Elle a été totalement éradiquée le...). Selon les chercheurs, Mimivirus et Megavirus chilensis pourraient constituer l'�bauche d'une nouvelle famille, celle des Megaviridae, qui regrouperait les virus dont le g�nome, ou celui de leur anc�tre, est d'une taille sup�rieure � un million de paires de bases.
Figure: La capside de Megavirus chilensis, observ�e en microscopie �lectronique, est "chevelue" et plus grosse que celle de Mimivirus, qui �tait jusqu'alors consid�r� comme l'arch�type des virus g�ants.
� IGS, Jean-Michel Claverie
La d�couverte la plus remarquable de cette �tude est l'existence chez Megavirus chilensis de sept enzymes-cl�s de l'appareil de traduction, des aminoacyl tRNA synth�tases, dont la fonction est de charger les bons acides amin�s sur les bons ARNs de transfert, assurant ainsi le respect absolu du code g�n�tique (Le code génétique désigne le système de correspondance mis en jeu lors de la transformation de l'information génétique des gènes en protéines, au cours...). La pr�sence suppl�mentaire de trois de ces enzymes, par rapport aux quatre autres d�j� identifi�es chez Mimivirus, confirme l'hypoth�se pr�c�demment �mise par les chercheurs, selon laquelle les g�nes correspondants ont �t� h�rit�s d'un anc�tre commun aux Megaviridae, qui devait donc poss�der un appareil de traduction. Ce sc�nario �volutif est en rupture totale avec la vision traditionnelle qui attribue la pr�sence de ces fonctions de type cellulaire chez les virus g�ants � leur "kleptomanie g�n�tique (La génétique (du grec genno γεννώ = donner naissance) est la science qui étudie l'hérédité et les gènes.)", c'est-�-dire � une capacit� particuli�re � voler des g�nes au hasard (Dans le langage ordinaire, le mot hasard est utilisé pour exprimer un manque efficient, sinon de causes, au moins d'une reconnaissance de cause à effet d'un...) dans les cellules qu'ils infectent. Les scientifiques pr�cisent que leur nouveau sc�nario pourrait s'�tendre aux grands virus � ADN plus traditionnels comme Poxvirus, Iridovirus, Phycodnavirus, Asfarvirus ou Herpesvirus, puisqu'il est largement admis qu'ils partagent une origine commune avec Mimivirus et par extension, avec les Megaviridae.
L'ensemble (En théorie des ensembles, un ensemble désigne intuitivement une collection d’objets (les éléments de l'ensemble), « une multitude qui...) de ces r�sultats renforcent l'int�r�t fondamental de l'analyse d�taill�e des virus g�ants, vus comme des fossiles vivants d'organismes cellulaires ancestraux qui ne sont peut-�tre plus repr�sent�s aujourd'hui. Megavirus chilensis pourrait ainsi avoir conserv� certains des processus mol�culaires fondamentaux � l'oeuvre dans les toutes premi�res cellules eucaryotes.
R�f�rence:
Distant Mimivirus relative with a larger genome highlights the fundamental features of Megaviridae, Defne Arslan, Matthieu Legendre, Virginie Seltzer, Chantal Abergel, Jean-Michel Claverie, PNAS, Published online before print October 10, 2011, doi: 10.1073/pnas.1110889108 PNAS October 10, 2011.
Source: CNRS-INSB
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