Chloroflexota
# Chloroflexota

Les Chloroflexota – anciennement Chlorobacteria (en français les Chlorobactéries) – forment un embranchement (ou phylum, ou encore division) du règne des Bacteria. Son nom provient de Chloroflexus qui est le genre type de cet embranchement.

Certains auteurs pensent que ce phylum pourrait être l'un des plus anciens existant encore.

## Historique

Thomas Cavalier-Smith a fait du phylum Chlorobacteria un des phylums de sa classification. Il est possible que ce soit l'embranchement bactérien le plus ancien qui existe encore à l'heure actuelle : la racine de l'arbre du vivant pourrait donc se trouver parmi les chlorobactéries ou bien entre les chlorobactéries et le reste du vivant.

Les chlorobactéries tirent leur nom du genre Chloroflexus, qui a lui-même donné son nom à la classe des Chloroflexi. Les chlorobactéries possèdent des métabolismes variés même si le plus typique est la photohétérotrophie anoxygénique des chloroflèxes. En 2021, Oren et Garrity rectifient la nomenclature des phyla bactérien et parmi ceux-ci celui des chlorobactéries qui deviennent les Chloroflexota.

## Taxonomie

### Étymologie

L'étymologie de ce phylum Chloroflexota est la suivante : Chlo.ro.fle.xo’ta N.L. masc. n. Chloroflexus, genre type de ce phylum; N.L. neut. pl. n. suff. -ota, suffixe pour définir un phylum; N.L. neut. pl. n. Chloroflexota, le phylum des $Chloroflexus^,.$

### Liste des classes

Selon la LPSN (11 novembre 2022) :

* Anaerolineae Yamada et al. 2006
* Ardenticatenia Kawaichi et al. 2013
* Caldilineae Yamada et al. 2006
* Chloroflexia corrig. Gupta et al. 2013
* Dehalococcoidia Löffler et al. 2013
* Ktedonobacteria corrig. Cavaletti et al. 2007
* Tepidiformia Kochetkova et al. 2020
* Thermoflexia Dodsworth et al. 2014

### Liste des Candidatus

Selon la LPSN (11 novembre 2022), plusieurs classes n'ont pas été publiées de manière valide et sont en attente de validation:

* "Candidatus Bathosphaeria" Mehrshad et al. 2018
* "Candidatus Limnocylindria" Mehrshad et al. 2018
* "Candidatus Thermofontia" corrig. Ward et al. 2018
* "Candidatus Umbricyclopia" Mehrshad et al. 2018

## Controverse sur leur structure

Les chlorobactéries sont traditionnellement considérées comme des bactéries Gram négative à structure bimembranée. Il semblerait pourtant que certains membres aient une structure unimembranée, ce qui jette le doute sur la monophylie de ce taxon.

## Classification

‘Candidatus Chlorothrix’♠

* ‘Candidatus Chlorothrix halophila’♠

Classe Anaerolineae

* Anaerolineales
   * Anaerolineaceae
      * Anaerolinea
         * A. thermolimosa
         * A. thermophila
      * Bellilinea
         * Bellilinea caldifistulae
      * Leptolinea
         * Leptolinea tardivitalis
      * Levilinea
         * Levilinea saccharolytica
      * Longilinea
         * Longilinea arvoryzae
* Caldilineales
   * Caldilineaceae
      * Caldilinea
         * C. aerophila
         * C. tarbellica♠

Classe Chloroflexi

* Kouleothrix♠
   * Kouleothrix aurantiaca♠
* Chloroflexales
   * Dehalobium♠
      * Dehalobium chlorocoercia♠
   * Chloroflexaceae
      * Chloroflexus
         * C. aggregans
         * C. aurantiacus
      * Chloronema
         * Chloronema giganteum
      * Heliothrix
         * Heliothrix oregonensis
      * Roseiflexus
         * Roseiflexus castenholzii
   * Oscillochloridaceae
      * Oscillochloris
         * O. chrysea
         * O. trichoides
* Herpetosiphonales
   * Herpetosiphonaceae
      * Herpetosiphon
         * H. aurantiacus
         * H. geysericola

Classe Dehalococcoidetes

* Dehalococcoides♠
   * Dehalococcoides ethenogenes♠
* Dehalogenimonas♠
   * Dehalogenimonas lykanthroporepellens ♠

Classe Ktedonobacteria

* Ktedonobacterales
   * Ktedonobacteraceae
      * Ktedonobacter
         * Ktedonobacter racemifer
   * Thermosporotrichaceae
      * Thermosporothrix
         * Thermosporothrix hazakensis
* Thermogemmatisporales
   * Thermogemmatisporaceae
      * Thermogemmatispora
         * T. foliorum♠
         * T. onikobensis♠

Classe Thermomicrobia

* Thermobaculum♠
   * Thermobaculum terrenum♠
* Thermomicrobiales
   * Thermomicrobiaceae
      * Thermomicrobium
         * Thermomicrobium roseum
* Sphaerobacterales
   * Sphaerobacteraceae
      * Sphaerobacter
         * Sphaerobacter thermophilus

Note: ♠ Strain found at the National Center for Biotechnology Information (NCBI) but not recognised by List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) or published by International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSB/IJSEM).

