Chemistry Development Kit
# Chemistry Development Kit

Le Chemistry Development Kit (CDK) est une bibliothèque open source développée en Java pour la chémoinformatique et la bio-informatique. Cette bibliothèque est disponible pour les systèmes Windows, Unix, et Mac OS X. CDK est distribué sous licence GNU LGPL.

## Historique

Le projet CDK a démarré en 2000 par Christoph Steinbeck, Egon Willighagen et Dan Gezelter, les développeurs de Jmol et JChemPaint, afin de créer une base de code commun à ces deux projets. Depuis, de nombreuses personnes ont contribué au projet, permettant le développement de nombreuses fonctionnalités détaillées ci-dessous.

## Bibliothèque

La bibliothèque CDK ne comporte pas d'exécutable utilisable par les utilisateurs finaux. Toutefois, CDK a été intégré dans plusieurs logiciels afin de rendre ses fonctionnalités disponibles (par exemple, CDK-Taverna, Bioclipse et Cinfony).

## Fonctionnalités principales

### Chemo-informatique

* Édition et génération de molécules en 2D
* Génération de coordonnées 3D
* Recherche structurale (sous-structure ou structure exacte)
* Calcul de descripteurs QSAR (e.g. PubMed 16959190)
* Calcul d'empreintes binaires (fingerprint)
* Calcul de champs de force
* Support de nombreux formats de fichier chimique
* Génération de structures

### Bio-informatique

* Détection des sites actifs des protéines
* Détection de ligands similaires DOI 10.1016/j.jmb.2006.09.041

### Général

* Adaptateur Python
* Adaptateur Ruby
* Communauté d'utilisateurs active
* Newsletter: CDK News
