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L'ISM coordonne actuellement onze regroupements scientifiques. Un regroupement, comme par exemple celui d'Algèbre et théorie des nombres, c'est le rassemblement de tous les professeurs, stagiaires postdoctoraux et étudiants des universités membres dont les principaux intérêts de recherche sont reliés au même thème. Sa coordination est assurée par un comité composé d'un professeur par université. Son rôle consiste dans la planification des cours ISM offerts chaque année, l'animation des séminaires de recherche, et la participation à la sélection des stagiaires postdoctoraux CRM-ISM.
Algèbre et Théorie des nombres Analyse
Combinatoire et calcul algébrique
Dynamique non-linéaire
Géométrie et topologie
Mathématiques actuarielles et financières Mathématiques appliquées et calcul scientifique
Physique mathématique
Probabilités
Théorie des catégories et applications