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近20年来，随着滇池周围的经济发展和城市规模的扩大，加重了滇池流域生态环境的压力，导致湖泊严重富营养化，内湖水呈暗黄绿色，含有有机、有害、有毒物质，大量氮、磷、重金属及砷沉积于湖底，形成底质很厚、很肥的淤泥；淤泥中有动植物残体、呈黑色，味极臭。滇池平均深度仅剩4米，不及早期深度10米的一半。为保护滇池，1988年7月1日起颁布实施的昆明市地方性法规《滇池保护条例》以提升滇池的水质，并减少污染，2013年1月1日政府根据《滇池保护条例》进行修正并重新执行，除了规范污水排放之外，还设立滇池保护专项资金来进行生态补偿，目的不但要减轻滇池的污染状况外，还要回复滇池的天然原貌。在「城镇化中国Urbachina」第三次年度大会中，与会成员参观了滇池边从事环保高新技术开发的公司，其净化滇池水质的方式，是以构建滇池蓝藻水华屏障，并剔除蓝藻与水体物理化过滤的净化，剔除的蓝藻通过压滤机压滤脱水，获得含水量为75～80％藻饼，此藻饼可进一步形成无害资源化生产生物有机肥料。而经由蓝藻物理提取的水质净化，可实现劣Ⅴ类水净化后能达到地表Ⅳ类水。然而，虽然透过水质净化后，滇池的污染程度已有明显改善，但以滇池的污染情况与水质净化的速度来说，昆明市的企业及政府单位仍有很漫长的路途要走。