Polimerasa
# Polimerasa

La polimerasa es una enzima capaz de transcribir o replicar ácidos nucleicos, que resultan cruciales en la división celular (ADN polimerasa) y en la transcripción del ADN (ARN polimerasa). La ADN polimerasa y la ARN polimerasa se utilizan para ensamblar moléculas de ADN y ARN, respectivamente, copiando una hebra de plantilla de ADN usando interacciones de emparejamiento de bases o ARN mediante replicación de media escalera.

La ADN polimerasa es la enzima que lleva a cabo la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), una técnica que ha desempeñado un papel esencial en el desarrollo de la genética.

Una polimerasa puede depender de la plantilla o ser independiente de la plantilla. La poli(A)-ARN-Polimerasa (PAP) es un ejemplo de polimerasa independiente de la plantilla. También se sabe que la terminal desoxirribonucleotidil transferasa (TdT) tiene actividades independientes del molde y dependientes del molde.

## Diferenciación

| Tipo | Abreviatura | Plantilla → Producto | Función |
| - | - | - | - |
| ADN-dependiente ADN polimerasa | DDDP | ADN → ADN | Replicación |
| ARN-dependiente ADN polimerasa | RDDP | ARN → ADN | Transcripción inversa |
| ADN-dependiente ARN polimerasa | DDRP | ADN → ARN | Transcripción |
| ARN-dependiente ARN polimerasa | RDRP | ARN → ARN | Replicación de los Virus ARN |
| independiente ARN polimerasa | | → ARN | |
| independiente ADN polimerasa | | → ADN | |

## Clasificación

* ADN-dependiente ADN polimerasa (DDDP)
   * Familia A: Incluye las ADN polimerasas eucariotas γ, θ, ν y la procariota I.
   * Familia B: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ζ, α, δ, ε y la procariota II. También se ha propuesto la inclusión de algunas ADN polimerasas virales.
   * Familia D: Incluye la ADN polimerasa procariota D y también se ha propuesto la inclusión de algunas ADN polimerasas virales.
   * Familia X: Incluye las ADN polimerasas eucariotas β, σ, λ, μ, TDT y la procariota III.
   * Familia Y: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ι, κ, η y las procariotas IV y V.
* ADN-dependiente ARN polimerasa (DDRP)
   * Multi-subunidad (msDdRP): Incluye las ARN polimerasas eucariota I, II, II, IV, V, la ARNP bacteriana y la ARNP arqueana.
   * Subunidad única (ssDdRP): incluye la ARN polimerasa T7 y la POLRMT.
   * Primasa, PrimPol.
* ARN-dependiente ADN polimerasa (RDDP)
   * Transcriptasa inversa (RT)
   * Telomerasa
* ARN-dependiente ARN polimerasa (RDRP)
   * RdRP viral
   * cRdRP eucariota (en algunos eucariotas infectados por virus de ARN)
* Elongación de ARN sin plantilla
   * PAP, PNPase

## Demostración

Un ejemplo de la ARN polimerasa, que funciona sin plantilla, es la poli(A)-ARN-Polimerasa (PAP), que se une a la cola poli(A) de la molécula del ARNm. La terminal desoxirribonucleotidil transferasa (TdT) es una ADN polimerasa independiente de la plantilla.

## Por estructura

Las polimerasas generalmente se dividen en dos superfamilias, con pliegue de "mano derecha" y pliegue de "barril beta doble psi" (a menudo simplemente "doble barril"). El primero se ve en casi todas las ADN polimerasas y casi todas las polimerasas virales de subunidad única; están marcados por un dominio de "palma" conservado. Este último se observa en todas las ARN polimerasas de múltiples subunidades, en la cRdRP y en las ADN polimerasas de la "familia D" que se encuentran en las arqueas. La familia "X" representada por la ADN polimerasa beta tiene solo una forma vaga de "palma" y, a veces, se considera una superfamilia diferente.

Las primas generalmente no entran en ninguna categoría. Por ejemplo las primasas bacterianas suelen tener el dominio Toprim y están relacionadas con las topoisomerasas y la helicasa centelleo mitocondrial. Las primasas eucariotas y arqueanas forman una familia AEP no relacionada, posiblemente relacionada con la polimerasa palma. Sin embargo, ambas familias se asocian al mismo conjunto de helicasas.

