Conformazioni del DNA
# Conformazioni del DNA

Le conformazioni di DNA a doppia elica fino ad ora evidenziate sono almeno una dozzina. Tre di queste sono ritenute essere presenti in natura: A-DNA, B-DNA e Z-DNA. La forma B è quella originariamente descritta da James Dewey Watson e Francis Crick ed è ritenuta essere quella predominante nelle cellule. Essa è larga 23.7 Å e si estende per 34 Å ogni 10 bp. Questa doppia elica compie un giro completo attorno all'asse ogni 10.4-10.5 paia di basi. Questa frequenza di rotazione, nota come passo dell'elica dipende largamente dalle forze di stacking che ogni base esercita su quelle adiacenti.

## A-, B- e Z-DNA

A-DNA e Z-DNA differiscono in modo significativo nella geometria e nelle dimensioni dal B-DNA, sebbene presentino una struttura a doppia elica. La conformazione A si presenta più frequentemente in campioni di DNA anidro, come negli esperimenti di cristallografia, e negli eteroduplex (eliche ibride da appaiamento di DNA ed RNA). La conformazione Z è invece tipica delle regioni metilate del DNA, nelle quali i filamenti si avvolgono in senso opposto attorno all'asse. Anche il DNA complessato con proteine si conforma spesso in forma Z anche se la sua presenza non è stata ancora dimostrata in vivo.

Caratteristiche delle principali forme di DNA :

| | A-DNA | B-DNA | Z-DNA |
| - | - | - | - |
| Senso dell'elica | destrorso | destrorso | sinistrorso |
| Unità ripetuta | 1 bp | 1 bp | 2 bp |
| Rotazione/bp | 32.7° | 34.3° | 60°/2bp |
| bp medie/giro | 11 | 10.5 | 12 |
| Inclinazione delle bp rispetto all'asse | +19° | -1.2° | -9° |
| Passo/bp lungo l'asse | 2.3 Å | 3.32 Å | 3.8 Å |
| Passo/giro d'elica | 24.6 Å | 33.2 Å | 45.6 Å |
| Propeller twist medio | +18° | +16° | 0° |
| Diametro | 23 Å (2.3 nm) | 20 Å (2.0 nm) | 18 Å (1.8 nm) |

## Altre conformazioni

Oltre ad A-, B- e Z-DNA, sono possibili anche altre conformazioni. Sono state finora evidenziate C-DNA, D-DNA, E-DNA, H-DNA, L-DNA S-DNA e P-DNA.

