Abi prism collection
# Abi prism collection

Abi prism collection est le logiciel chargé de faire la collecte des données brutes d'électrophorèse sur le séquenceur de gène Abi prism 310.

Le logiciel permet :

* de faire son plan de plaque : noms des échantillons et position sur la plaque
* de lancer l'électrophorèse

Le logiciel effectue le pilotage de l'instrument afin de collecter les données brutes. La séquence des opérations est :

* fermeture du canal du gel bloc du côté de la cuve de tampon,
* coulage d'un nouveau polymère dans le capillaire entre chaque échantillon en agissant sur le piston relié à la seringue de polymère au niveau du gel block. Le vieux polymère est jeté dans le tube poubelle en position trois,
* réouverture du canal du gel block,
* positionnement dans le tube de la plaque correspondant à l'échantillon suivant,
* électro-injection dans le tube,
* rinçage de l'électrode et du capillaire,
* lancement de l'électrophorèse,
* collecte des données d'électrophorèse au bout d'un temps préprogrammé,
* arrêt de la collecte au bout d'un autre temps préprogrammé (30 minutes généralement en gene scan ou 3 heures en séquence)
* appel du programme d'analyse des données (gene-scan analysis ou sequencing analysis)
* passage à l'échantillon suivant : le cycle recommence
