تولى حسام البدرى تدريب المريخ السودانى فى موسم 2010-2011، وعاد بعدها لتدريب إنبى، ثم إلى الأهلى المصرى، ثم إلى أهلى طرابلس فى بداية عام 2013، ولكنه لم يستمر طويلا، وعاد لتدريب منتخب الشباب تحت 23 عاما فى نفس العام.