تقع الجامعة في مدينة ود مدني في ولاية الجزيرة نظرا لاهمية الولاية من الناحية الزراعية و الاقتصادية, و تنقسم الى عدة مجمعات دراسية يتراسهن مجمع الرازي الذي تقع فيه رئاسة الجامعة و اشهر كليات الجامعة و هي كلية الطب .