Wat suggereren de stammen van y. pestis tegen de pest?
Uit de studie bleek ook dat er twee voorheen onbekende maar verwante clades (genetische takken) van het Y. pestis- genoom waren die verband hielden met middeleeuwse massagraven. Deze clades (waarvan wordt gedacht dat ze uitgestorven zijn) bleken de voorouders te zijn van moderne isolaten van de moderne Y. pestis- stammen Y. p. orientalis en Y. p. medievalis, wat suggereert dat de pest in twee golven Europa is binnengekomen. Onderzoeken van overblijfselen van pestputten in Frankrijk en Engeland geven aan dat de eerste variant Europa binnenkwam via de haven van Marseille rond november 1347 en zich in de daaropvolgende twee jaar door Frankrijk verspreidde, om uiteindelijk Engeland te bereiken in het lente van 1349, waar het zich door het land verspreidde in drie epidemieën. Onderzoeken van overblijfselen van de pestkuil in de Nederlandse stad Bergen op Zoom toonden aan dat het Y. pestis-genotype dat verantwoordelijk was voor de pandemie die zich vanaf 1350 door de Lage Landen verspreidde, verschilde van het genotype dat in Groot-Brittannië en Frankrijk werd gevonden, wat erop wijst dat Bergen op Zoom (en mogelijk andere delen van Zuid-Nederland) in 1349 niet rechtstreeks vanuit Engeland of Frankrijk werd besmet en suggereert dat een tweede pestgolf, anders dan die in Groot-Brittannië en Frankrijk, mogelijk vanuit Noorwegen, de Hanzesteden of een andere locatie naar de Lage Landen is overgebracht.
de pest in twee golven Europa is binnengekomen