Alonissos imekuwa ikikaa kwa muda mrefu kuliko kisiwa kingine chochote cha Aegean, ikikadiriwa na wataalamu wa akiolojia kuwa tarehe kutoka 100,000 KK, na ilikuwa na thamani na viongozi wengi katika nyakati za kale za Kigiriki.
Katika enzi ya kale ya Ugiriki, Alonissos aliheshimiwa sana.
Visiwa vingine vya Aegean vilikaliwa kabla ya Alonissos.