اغلق السجن عام 2006 اثر انتهاكات ارتكبها جنود امريكيون ضد سجناء عراقيين ونقلت وكالة الانباء الفرنسية عن مصدر أمني عراقي أن حريقا اندلع في السجن بعد ظهر الجمعة اثر مواجهات بين سجناء وعدد من الحراس كانوا يقومون بجولة تفتيشية عن ممنوعات أو مواد خطرة كالسكاكين أو مخدرات. وأضاف المصدر أن الشرطة "أرسلت فوجا من قوات الطوارىء، كما تدخلت قوة من الجيش لتهدئة الاوضاع". وذكر شهود عيان أن المواجهات بدأت بعد ظهر الخميس حيث سمع إطلاق نار داخل السجن. وكان عدد من السجناء أشعلوا حريقا ليل الخميس خلال أعمال شغب في السجن. وأكد أحمد الخفاجي نائب وزير الداخلية العراقي في وقت متأخر ليل الخميس أنه تمت السيطرة على الحريق الذي تسبب في إصابات بين العاملين، بينما لم يصب أحد من السجناء. يذكر أن وزارة العدل العراقية أعادت افتتاح سجن ابو غريب في 22 فبراير/ شباط الماضي بعد إغلاقه عام 2006 إثر تجاوزات ارتكبتها القوات الامريكية ضد المعتقلين العراقيين. واطلقت الوزارة اسم "سجن بغداد المركزي" على المنشأة التي تسع ما بين 12 ألفا إلى 15 ألفا من السجناء.