Il presbiterio viene costruito a partire dal 1564. Nelle vele in cui s'imposta la seconda cupola che copre l'altare maggiore, sono rappresentate otto sibille disposte a coppia, dipinte da Guglielmo Caccia, detto il Moncalvo. Ogni sibilla ha un nastro dipinto con le citazioni in latino di profezie che sono rilette in chiave mariana. La cupola, in cui sono dipinti dei rosoni, presenta un effetto prospettico.