كما أصدرت البعثة تقارير مواضيعية في غواتيمالا بشأن أداء السلطة القضائية (2000)، ونظام السجون (2000)، والشرطة الوطنية (1999-2001)، وأعمال القتل الغوغائي دون محاكمة (2000-2002) والتمييز ضد الشعوب الأصلية (2001)، والأمن العام (2003).
The Mission has also issued thematic reports in Guatemala on the functioning of the judiciary (2000), the prison system (2000), the national police (1999, 2001), lynchings (2000, 2002), discrimination against indigenous peoples (2001) and public security (2003).