وتتمثل المشاكل الرئيسية التي تعرقل فعالية خدمات النقل العابر عبر هذه الطرق المائية في ضعف الهياكل الأساسية (القدرة الاستيعابية للسفن المعينات الملاحية والاتصالات بالراديو، إلخ) وانعدام إطار قانوني ملائم يحكم العمليات في الأنهار/البحيرات وعدم فعالية تدابير منع التلوث وتعزيز السلامة ووجود عقبات أيضا في مجال التنفيذ تتعلق بالتواصل مع الوسائل الأخرى في سلسلة النقل العابر.
The key problems impeding the efficiency of transit services along such waterways are poor infrastructure (vessel capacity, navigational aids, radio communications etc.), the lack of an appropriate legal framework to govern river/lake operations, and ineffective measures to prevent pollution and promote safety. There are also operational bottlenecks related to the interface with other modes in the transit transport chain.