وصدر توجيهـان رئـاسيـان على إثر تعرض بالي للهجوم بالقنابل، وهما التوجيه الرئاسي رقم 4 لعام 2002 الذي يتضمن تعليمات للوزيـر الذي يتولى التنسيق بين الشؤون السياسية والأمنية لوضع سياسة شاملة في مجال مكافحة الإرهاب، والتوجيه الرئاسي رقم 5 لعام 2002 الذي يتضمن تعليمات موجهة إلى رئيس وكالة الاستخبارات الوطنية لتنسيق أنشطة جميع وكالات الاستخبارات الأخرى.
Two Presidential Instructions were also issued in the aftermath of the Bali bombing tragedy, namely Presidential Instruction No. 4/2002 instructing the Coordinating Minister for Political and Security Affairs to formulate a comprehensive policy in combating terrorism, and Presidential Instruction No. 5/2002 instructing the Head of the National Intelligence Agency to coordinate the activities of all the other intelligence agencies.