Основан от принцеса Хуана де Австрия, дъщеря на императора на Свещената Римска империя Карлос V, през 1566 г., дворецът е превърнат в манастир от архитекта, отговорен за Ел Ескориал.
Принцеса Хуана Австрийска е била дълбоко религиозна личност.