От 1506 до 1626 г. той се променя от простия основен план на гръцки кръст с четири рамена с еднаква дължина, предпочитан от Браманте и неговия заклет враг Микеланджело, до окончателната форма на латинския кръст на Мадерно, удължен от дълъг кораб, като изискван от папите на Контрареформацията.
След края на Контрареформацията някои хора искаха дизайнът да бъде променен обратно.