Многото оцелели произведения на изкуството и артефакти на Кофукуджи се съхраняват в най-новата му сграда, Музея на националните съкровища, огнеупорно хранилище, построено през 1958 г. в чест на огромното културно и историческо значение на Кофукуджи.
Огнеупорното хранилище, построено през 1958 г., се счита за достатъчно за защита на артефактите.