Климатът съответно варира от заснежения северен край на Хокайдо, който предлага отлични условия за каране на ски, до субтропичния регион на Южен Кюшу и Окинава, с неговите популярни коралови рифове.
Кораловите рифове могат да бъдат намерени на върха на Хокайдо.